Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ST3GAL4Q11206 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ST3GAL4Q11206 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ST3GAL4Q11206 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ST3GAL4Q11206 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ST3GAL4Q11206 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ST3GAL4Q11206 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ST3GAL4Q11206 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ST3GAL4Q11206 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ST3GAL4Q11206 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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