Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ST3GAL4Q11206 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ST3GAL4Q11206 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ST3GAL4Q11206 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ST3GAL4Q11206 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ST3GAL4Q11206 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ST3GAL4Q11206 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ST3GAL4Q11206 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ST3GAL4Q11206 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ST3GAL4Q11206 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ST3GAL4Q11206 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ST3GAL4Q11206 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ST3GAL4Q11206 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ST3GAL4Q11206 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ST3GAL4Q11206 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ST3GAL4Q11206 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ST3GAL4Q11206 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ST3GAL4Q11206 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ST3GAL4Q11206 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ST3GAL4Q11206 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ST3GAL4Q11206 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ST3GAL4Q11206 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ST3GAL4Q11206 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ST3GAL4Q11206 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ST3GAL4Q11206 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ST3GAL4Q11206 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ST3GAL4Q11206 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ST3GAL4Q11206 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ST3GAL4Q11206 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ST3GAL4Q11206 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ST3GAL4Q11206 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ST3GAL4Q11206 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ST3GAL4Q11206 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ST3GAL4Q11206 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ST3GAL4Q11206 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ST3GAL4Q11206 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ST3GAL4Q11206 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ST3GAL4Q11206 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ST3GAL4Q11206 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ST3GAL4Q11206 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ST3GAL4Q11206 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ST3GAL4Q11206 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ST3GAL4Q11206 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ST3GAL4Q11206 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ST3GAL4Q11206 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ST3GAL4Q11206 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ST3GAL4Q11206 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ST3GAL4Q11206 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ST3GAL4Q11206 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ST3GAL4Q11206 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ST3GAL4Q11206 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ST3GAL4Q11206 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ST3GAL4Q11206 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ST3GAL4Q11206 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ST3GAL4Q11206 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ST3GAL4Q11206 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ST3GAL4Q11206 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ST3GAL4Q11206 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ST3GAL4Q11206 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ST3GAL4Q11206 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ST3GAL4Q11206 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ST3GAL4Q11206 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ST3GAL4Q11206 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ST3GAL4Q11206 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ST3GAL4Q11206 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ST3GAL4Q11206 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ST3GAL4Q11206 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ST3GAL4Q11206 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ST3GAL4Q11206 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ST3GAL4Q11206 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ST3GAL4Q11206 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ST3GAL4Q11206 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ST3GAL4Q11206 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ST3GAL4Q11206 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ST3GAL4Q11206 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ST3GAL4Q11206 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ST3GAL4Q11206 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ST3GAL4Q11206 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ST3GAL4Q11206 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ST3GAL4Q11206 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ST3GAL4Q11206 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ST3GAL4Q11206 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms