Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CKAP4Q07065 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CKAP4Q07065 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CKAP4Q07065 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CKAP4Q07065 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CKAP4Q07065 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms