Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB3Q05901 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNB3Q05901 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNB3Q05901 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB3Q05901 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB3Q05901 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms