Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHRNB3Q05901 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CHRNB3Q05901 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CHRNB3Q05901 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHRNB3Q05901 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHRNB3Q05901 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNB3Q05901 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CHRNB3Q05901 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
CHRNB3Q05901 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHRNB3Q05901 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHRNB3Q05901 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHRNB3Q05901 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHRNB3Q05901 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CHRNB3Q05901 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNB3Q05901 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNB3Q05901 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNB3Q05901 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHRNB3Q05901 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNB3Q05901 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNB3Q05901 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNB3Q05901 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHRNB3Q05901 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNB3Q05901 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNB3Q05901 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNB3Q05901 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNB3Q05901 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHRNB3Q05901 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNB3Q05901 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNB3Q05901 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNB3Q05901 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNB3Q05901 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CHRNB3Q05901 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CHRNB3Q05901 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHRNB3Q05901 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNB3Q05901 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNB3Q05901 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CHRNB3Q05901 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHRNB3Q05901 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHRNB3Q05901 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNB3Q05901 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHRNB3Q05901 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHRNB3Q05901 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHRNB3Q05901 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHRNB3Q05901 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNB3Q05901 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHRNB3Q05901 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHRNB3Q05901 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHRNB3Q05901 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHRNB3Q05901 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHRNB3Q05901 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHRNB3Q05901 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNB3Q05901 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNB3Q05901 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNB3Q05901 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNB3Q05901 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRNB3Q05901 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRNB3Q05901 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRNB3Q05901 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRNB3Q05901 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNB3Q05901 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNB3Q05901 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNB3Q05901 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNB3Q05901 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNB3Q05901 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNB3Q05901 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNB3Q05901 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRNB3Q05901 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNB3Q05901 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHRNB3Q05901 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRNB3Q05901 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRNB3Q05901 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNB3Q05901 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRNB3Q05901 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHRNB3Q05901 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRNB3Q05901 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNB3Q05901 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHRNB3Q05901 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNB3Q05901 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHRNB3Q05901 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNB3Q05901 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNB3Q05901 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNB3Q05901 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNB3Q05901 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.5 ms