Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HBBP68871 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HBBP68871 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HBBP68871 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HBBP68871 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HBBP68871 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
HBBP68871 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HBBP68871 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HBBP68871 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HBBP68871 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HBBP68871 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HBBP68871 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HBBP68871 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HBBP68871 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HBBP68871 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HBBP68871 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HBBP68871 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HBBP68871 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBBP68871 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBBP68871 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBBP68871 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HBBP68871 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBBP68871 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBBP68871 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBBP68871 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBBP68871 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HBBP68871 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBBP68871 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBBP68871 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBBP68871 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HBBP68871 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HBBP68871 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBBP68871 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBBP68871 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBBP68871 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBBP68871 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HBBP68871 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBBP68871 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBBP68871 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBBP68871 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBBP68871 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBBP68871 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HBBP68871 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HBBP68871 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBBP68871 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBBP68871 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBBP68871 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBBP68871 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HBBP68871 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBBP68871 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBBP68871 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBBP68871 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HBBP68871 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HBBP68871 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBBP68871 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBBP68871 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBBP68871 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBBP68871 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBBP68871 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HBBP68871 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBBP68871 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBBP68871 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBBP68871 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HBBP68871 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBBP68871 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBBP68871 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBBP68871 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBBP68871 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HBBP68871 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HBBP68871 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBBP68871 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBBP68871 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HBBP68871 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBBP68871 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBBP68871 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBBP68871 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBBP68871 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HBBP68871 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBBP68871 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBBP68871 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBBP68871 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HBBP68871 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBBP68871 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBBP68871 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBBP68871 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HBBP68871 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBBP68871 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBBP68871 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBBP68871 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HBBP68871 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HBBP68871 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms