Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBB4BP68371 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBB4BP68371 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBB4BP68371 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TUBB4BP68371 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBB4BP68371 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms