Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TUBB4BP68371 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
TUBB4BP68371 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TUBB4BP68371 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TUBB4BP68371 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TUBB4BP68371 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TUBB4BP68371 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TUBB4BP68371 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TUBB4BP68371 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TUBB4BP68371 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TUBB4BP68371 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TUBB4BP68371 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TUBB4BP68371 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TUBB4BP68371 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TUBB4BP68371 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TUBB4BP68371 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TUBB4BP68371 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TUBB4BP68371 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TUBB4BP68371 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TUBB4BP68371 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUBB4BP68371 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TUBB4BP68371 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TUBB4BP68371 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TUBB4BP68371 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TUBB4BP68371 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TUBB4BP68371 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TUBB4BP68371 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TUBB4BP68371 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TUBB4BP68371 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TUBB4BP68371 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TUBB4BP68371 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TUBB4BP68371 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TUBB4BP68371 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TUBB4BP68371 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TUBB4BP68371 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TUBB4BP68371 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TUBB4BP68371 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TUBB4BP68371 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TUBB4BP68371 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TUBB4BP68371 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TUBB4BP68371 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TUBB4BP68371 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TUBB4BP68371 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TUBB4BP68371 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TUBB4BP68371 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TUBB4BP68371 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TUBB4BP68371 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TUBB4BP68371 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TUBB4BP68371 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TUBB4BP68371 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TUBB4BP68371 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TUBB4BP68371 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TUBB4BP68371 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TUBB4BP68371 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TUBB4BP68371 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TUBB4BP68371 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TUBB4BP68371 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TUBB4BP68371 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TUBB4BP68371 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TUBB4BP68371 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TUBB4BP68371 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TUBB4BP68371 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TUBB4BP68371 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TUBB4BP68371 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TUBB4BP68371 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TUBB4BP68371 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TUBB4BP68371 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TUBB4BP68371 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TUBB4BP68371 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TUBB4BP68371 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TUBB4BP68371 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TUBB4BP68371 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TUBB4BP68371 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TUBB4BP68371 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TUBB4BP68371 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TUBB4BP68371 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBB4BP68371 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TUBB4BP68371 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TUBB4BP68371 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TUBB4BP68371 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TUBB4BP68371 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TUBB4BP68371 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TUBB4BP68371 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TUBB4BP68371 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBB4BP68371 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TUBB4BP68371 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBB4BP68371 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
TUBB4BP68371 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
TUBB4BP68371 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBB4BP68371 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBB4BP68371 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TUBB4BP68371 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TUBB4BP68371 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TUBB4BP68371 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms