Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2BP67870 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSNK2BP67870 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSNK2BP67870 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK2BP67870 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK2BP67870 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms