Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOBP62745 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOBP62745 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOBP62745 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOBP62745 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RHOBP62745 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RHOBP62745 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHOBP62745 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHOBP62745 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHOBP62745 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RHOBP62745 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHOBP62745 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHOBP62745 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHOBP62745 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RHOBP62745 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RHOBP62745 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOBP62745 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOBP62745 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOBP62745 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOBP62745 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RHOBP62745 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOBP62745 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOBP62745 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHOBP62745 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOBP62745 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOBP62745 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOBP62745 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOBP62745 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHOBP62745 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOBP62745 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOBP62745 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOBP62745 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOBP62745 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOBP62745 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHOBP62745 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHOBP62745 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOBP62745 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOBP62745 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOBP62745 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHOBP62745 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHOBP62745 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOBP62745 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOBP62745 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOBP62745 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOBP62745 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RHOBP62745 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBP62745 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBP62745 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBP62745 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RHOBP62745 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBP62745 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBP62745 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBP62745 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBP62745 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBP62745 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOBP62745 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBP62745 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBP62745 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBP62745 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOBP62745 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOBP62745 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOBP62745 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOBP62745 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOBP62745 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOBP62745 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOBP62745 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOBP62745 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOBP62745 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOBP62745 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOBP62745 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBP62745 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBP62745 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBP62745 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBP62745 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBP62745 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBP62745 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBP62745 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBP62745 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBP62745 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms