Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN12P56749 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN12P56749 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN12P56749 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN12P56749 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms