Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARFIP2P53365 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARFIP2P53365 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARFIP2P53365 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFIP2P53365 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARFIP2P53365 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms