Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARFIP2P53365 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ARFIP2P53365 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARFIP2P53365 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARFIP2P53365 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARFIP2P53365 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARFIP2P53365 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ARFIP2P53365 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ARFIP2P53365 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ARFIP2P53365 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
ARFIP2P53365 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ARFIP2P53365 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ARFIP2P53365 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ARFIP2P53365 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ARFIP2P53365 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ARFIP2P53365 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ARFIP2P53365 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ARFIP2P53365 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ARFIP2P53365 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ARFIP2P53365 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ARFIP2P53365 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ARFIP2P53365 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ARFIP2P53365 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ARFIP2P53365 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ARFIP2P53365 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ARFIP2P53365 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARFIP2P53365 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ARFIP2P53365 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARFIP2P53365 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFIP2P53365 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFIP2P53365 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARFIP2P53365 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARFIP2P53365 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ARFIP2P53365 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ARFIP2P53365 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ARFIP2P53365 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ARFIP2P53365 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARFIP2P53365 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ARFIP2P53365 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ARFIP2P53365 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARFIP2P53365 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARFIP2P53365 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARFIP2P53365 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ARFIP2P53365 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ARFIP2P53365 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ARFIP2P53365 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ARFIP2P53365 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARFIP2P53365 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ARFIP2P53365 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ARFIP2P53365 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFIP2P53365 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ARFIP2P53365 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARFIP2P53365 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARFIP2P53365 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARFIP2P53365 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARFIP2P53365 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ARFIP2P53365 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ARFIP2P53365 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ARFIP2P53365 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFIP2P53365 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ARFIP2P53365 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ARFIP2P53365 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ARFIP2P53365 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ARFIP2P53365 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARFIP2P53365 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARFIP2P53365 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFIP2P53365 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFIP2P53365 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFIP2P53365 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFIP2P53365 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFIP2P53365 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFIP2P53365 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFIP2P53365 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFIP2P53365 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ARFIP2P53365 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ARFIP2P53365 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARFIP2P53365 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARFIP2P53365 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARFIP2P53365 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFIP2P53365 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARFIP2P53365 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFIP2P53365 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFIP2P53365 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARFIP2P53365 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFIP2P53365 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFIP2P53365 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARFIP2P53365 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFIP2P53365 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFIP2P53365 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFIP2P53365 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFIP2P53365 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFIP2P53365 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms