Protein–RNA interactions for Protein: P35367

HRH1, Histamine H1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH1P35367 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HRH1P35367 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HRH1P35367 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HRH1P35367 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HRH1P35367 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HRH1P35367 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HRH1P35367 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HRH1P35367 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HRH1P35367 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HRH1P35367 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HRH1P35367 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HRH1P35367 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HRH1P35367 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HRH1P35367 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HRH1P35367 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HRH1P35367 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HRH1P35367 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HRH1P35367 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HRH1P35367 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HRH1P35367 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HRH1P35367 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HRH1P35367 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HRH1P35367 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HRH1P35367 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HRH1P35367 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HRH1P35367 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HRH1P35367 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HRH1P35367 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HRH1P35367 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HRH1P35367 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HRH1P35367 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HRH1P35367 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HRH1P35367 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HRH1P35367 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HRH1P35367 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HRH1P35367 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HRH1P35367 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HRH1P35367 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HRH1P35367 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HRH1P35367 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HRH1P35367 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HRH1P35367 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HRH1P35367 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HRH1P35367 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HRH1P35367 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HRH1P35367 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HRH1P35367 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HRH1P35367 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HRH1P35367 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HRH1P35367 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HRH1P35367 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HRH1P35367 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HRH1P35367 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HRH1P35367 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HRH1P35367 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HRH1P35367 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HRH1P35367 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HRH1P35367 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HRH1P35367 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HRH1P35367 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HRH1P35367 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HRH1P35367 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HRH1P35367 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HRH1P35367 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HRH1P35367 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HRH1P35367 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HRH1P35367 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HRH1P35367 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HRH1P35367 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HRH1P35367 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HRH1P35367 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HRH1P35367 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HRH1P35367 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HRH1P35367 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HRH1P35367 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HRH1P35367 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HRH1P35367 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HRH1P35367 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HRH1P35367 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HRH1P35367 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HRH1P35367 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HRH1P35367 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HRH1P35367 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HRH1P35367 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HRH1P35367 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms