Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCK1P16333 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCK1P16333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCK1P16333 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCK1P16333 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCK1P16333 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCK1P16333 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCK1P16333 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCK1P16333 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCK1P16333 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCK1P16333 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCK1P16333 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCK1P16333 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCK1P16333 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCK1P16333 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCK1P16333 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NCK1P16333 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCK1P16333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCK1P16333 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCK1P16333 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCK1P16333 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCK1P16333 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCK1P16333 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCK1P16333 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCK1P16333 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCK1P16333 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCK1P16333 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCK1P16333 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCK1P16333 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCK1P16333 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCK1P16333 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCK1P16333 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCK1P16333 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCK1P16333 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCK1P16333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCK1P16333 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCK1P16333 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCK1P16333 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCK1P16333 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCK1P16333 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCK1P16333 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCK1P16333 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCK1P16333 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NCK1P16333 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCK1P16333 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCK1P16333 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCK1P16333 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCK1P16333 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCK1P16333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCK1P16333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NCK1P16333 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK1P16333 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK1P16333 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK1P16333 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK1P16333 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NCK1P16333 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK1P16333 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK1P16333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK1P16333 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NCK1P16333 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK1P16333 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK1P16333 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK1P16333 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCK1P16333 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK1P16333 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK1P16333 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK1P16333 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCK1P16333 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK1P16333 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK1P16333 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK1P16333 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK1P16333 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK1P16333 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCK1P16333 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCK1P16333 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK1P16333 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK1P16333 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK1P16333 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK1P16333 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK1P16333 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCK1P16333 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK1P16333 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK1P16333 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK1P16333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK1P16333 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCK1P16333 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK1P16333 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK1P16333 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCK1P16333 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCK1P16333 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCK1P16333 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCK1P16333 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCK1P16333 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCK1P16333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms