Protein–RNA interactions for Protein: P00995

SPINK1, Serine protease inhibitor Kazal-type 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK1P00995 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK1P00995 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPINK1P00995 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPINK1P00995 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK1P00995 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK1P00995 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK1P00995 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK1P00995 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK1P00995 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPINK1P00995 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK1P00995 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK1P00995 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK1P00995 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK1P00995 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK1P00995 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK1P00995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK1P00995 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK1P00995 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK1P00995 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK1P00995 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK1P00995 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK1P00995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK1P00995 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK1P00995 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK1P00995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK1P00995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPINK1P00995 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPINK1P00995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPINK1P00995 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPINK1P00995 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPINK1P00995 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPINK1P00995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPINK1P00995 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SPINK1P00995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms