Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MBD3O95983 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MBD3O95983 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MBD3O95983 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MBD3O95983 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MBD3O95983 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MBD3O95983 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MBD3O95983 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MBD3O95983 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MBD3O95983 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MBD3O95983 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MBD3O95983 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MBD3O95983 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MBD3O95983 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MBD3O95983 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MBD3O95983 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MBD3O95983 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MBD3O95983 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MBD3O95983 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MBD3O95983 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MBD3O95983 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MBD3O95983 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MBD3O95983 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MBD3O95983 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MBD3O95983 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MBD3O95983 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MBD3O95983 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MBD3O95983 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MBD3O95983 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MBD3O95983 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MBD3O95983 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MBD3O95983 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
MBD3O95983 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MBD3O95983 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MBD3O95983 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MBD3O95983 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MBD3O95983 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
MBD3O95983 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MBD3O95983 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MBD3O95983 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD3O95983 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD3O95983 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD3O95983 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD3O95983 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
MBD3O95983 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD3O95983 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD3O95983 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD3O95983 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD3O95983 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD3O95983 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MBD3O95983 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD3O95983 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MBD3O95983 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD3O95983 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MBD3O95983 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD3O95983 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD3O95983 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MBD3O95983 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD3O95983 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MBD3O95983 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD3O95983 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD3O95983 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD3O95983 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MBD3O95983 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD3O95983 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD3O95983 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD3O95983 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MBD3O95983 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD3O95983 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD3O95983 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MBD3O95983 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD3O95983 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD3O95983 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD3O95983 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD3O95983 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MBD3O95983 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD3O95983 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD3O95983 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
MBD3O95983 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD3O95983 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD3O95983 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MBD3O95983 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD3O95983 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD3O95983 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MBD3O95983 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD3O95983 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MBD3O95983 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD3O95983 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD3O95983 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
MBD3O95983 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MBD3O95983 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
MBD3O95983 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MBD3O95983 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms