Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTAGE9A4FU28 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTAGE9A4FU28 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTAGE9A4FU28 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CTAGE9A4FU28 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTAGE9A4FU28 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms