Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6X5

TRAV18, T-cell receptor alpha variable 18 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV18A0A075B6X5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAV18A0A075B6X5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAV18A0A075B6X5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAV18A0A075B6X5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAV18A0A075B6X5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAV18A0A075B6X5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms