Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ8

MAP1LC3B, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3BQ9GZQ8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MAP1LC3BQ9GZQ8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms