RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524506.5

RCE1-202, Transcript of Ras converting CAAX endopeptidase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RCE1, Length 1,379 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1-202ENST00000524506 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.02■■■■■ 6.4
RCE1-202ENST00000524506 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.89■■■■■ 5.42
RCE1-202ENST00000524506 ABCC9O60706 1549 aa48.84■■■■■ 5.41
RCE1-202ENST00000524506 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.48■■■■■ 5.03
RCE1-202ENST00000524506 NACADO15069 1562 aa46.15■■■■■ 4.98
RCE1-202ENST00000524506 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.1■■■■■ 4.97
RCE1-202ENST00000524506 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.81■■■■■ 4.92
RCE1-202ENST00000524506 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.74■■■■■ 4.91
RCE1-202ENST00000524506 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.73■■■■■ 4.91
RCE1-202ENST00000524506 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.51■■■■■ 4.88
RCE1-202ENST00000524506 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.5■■■■■ 4.87
RCE1-202ENST00000524506 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.45■■■■■ 4.87
RCE1-202ENST00000524506 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.1■■■■■ 4.81
RCE1-202ENST00000524506 SCRIBQ14160 1630 aa44.66■■■■■ 4.74
RCE1-202ENST00000524506 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
RCE1-202ENST00000524506 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.09■■■■■ 4.65
RCE1-202ENST00000524506 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
RCE1-202ENST00000524506 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.96■■■■■ 4.63
RCE1-202ENST00000524506 SMARCA4P51532 1647 aa42.69■■■■■ 4.42
RCE1-202ENST00000524506 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
RCE1-202ENST00000524506 NCAPD3P42695 1498 aa42.59■■■■■ 4.41
RCE1-202ENST00000524506 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.55■■■■■ 4.4
RCE1-202ENST00000524506 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.54■■■■■ 4.4
RCE1-202ENST00000524506 SMARCA2P51531 1590 aa42.45■■■■■ 4.39
RCE1-202ENST00000524506 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.4■■■■■ 4.38
RCE1-202ENST00000524506 HMGXB3Q12766 1538 aa42.28■■■■■ 4.36
RCE1-202ENST00000524506 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.28■■■■■ 4.36
RCE1-202ENST00000524506 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
RCE1-202ENST00000524506 ERCC6Q03468 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
RCE1-202ENST00000524506 CUX2O14529 1486 aa42■■■■■ 4.31
RCE1-202ENST00000524506 NESP48681 1621 aa41.97■■■■■ 4.31
RCE1-202ENST00000524506 WIZO95785 1651 aa41.9■■■■■ 4.3
RCE1-202ENST00000524506 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
RCE1-202ENST00000524506 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.65■■■■■ 4.26
RCE1-202ENST00000524506 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
RCE1-202ENST00000524506 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
RCE1-202ENST00000524506 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.44■■■■■ 4.22
RCE1-202ENST00000524506 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.42■■■■■ 4.22
RCE1-202ENST00000524506 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.33■■■■■ 4.21
RCE1-202ENST00000524506 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.05■■■■■ 4.16
RCE1-202ENST00000524506 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.01■■■■■ 4.16
RCE1-202ENST00000524506 CFTRP13569 1480 aa41.01■■■■■ 4.16
RCE1-202ENST00000524506 WDR62O43379 1518 aa40.92■■■■■ 4.14
RCE1-202ENST00000524506 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.91■■■■■ 4.14
RCE1-202ENST00000524506 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.87■■■■■ 4.13
RCE1-202ENST00000524506 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
RCE1-202ENST00000524506 PRDM2Q13029 1718 aa40.54■■■■■ 4.08
RCE1-202ENST00000524506 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
RCE1-202ENST00000524506 TRIM41Q8WV44 630 aa40.29■■■■■ 4.04
RCE1-202ENST00000524506 OSCARQ8IYS5 282 aa40.16■■■■■ 4.02
RCE1-202ENST00000524506 TOPBP1Q92547 1522 aa40.14■■■■■ 4.02
RCE1-202ENST00000524506 ABCC8Q09428 1581 aa40.11■■■■■ 4.01
RCE1-202ENST00000524506 IFT140Q96RY7 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
RCE1-202ENST00000524506 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.06■■■■■ 4
RCE1-202ENST00000524506 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
RCE1-202ENST00000524506 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
RCE1-202ENST00000524506 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
RCE1-202ENST00000524506 CUX1P39880 1505 aa39.79■■■■□ 3.96
RCE1-202ENST00000524506 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
RCE1-202ENST00000524506 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.69■■■■□ 3.945e-7■■■■□ 22.3
RCE1-202ENST00000524506 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.68■■■■□ 3.94
RCE1-202ENST00000524506 SOGA1O94964 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
RCE1-202ENST00000524506 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.64■■■■□ 3.94
RCE1-202ENST00000524506 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
RCE1-202ENST00000524506 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
RCE1-202ENST00000524506 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.62■■■■□ 3.93
RCE1-202ENST00000524506 CHD1O14646 1710 aa39.53■■■■□ 3.92
RCE1-202ENST00000524506 FBLN2P98095 1184 aa39.5■■■■□ 3.91
RCE1-202ENST00000524506 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.5■■■■□ 3.91
RCE1-202ENST00000524506 ARHGEF11O15085 1522 aa39.48■■■■□ 3.91
RCE1-202ENST00000524506 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
RCE1-202ENST00000524506 TOP2BQ02880 1626 aa39.38■■■■□ 3.9
RCE1-202ENST00000524506 SYNJ1O43426 1573 aa39.38■■■■□ 3.89
RCE1-202ENST00000524506 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.35■■■■□ 3.89
RCE1-202ENST00000524506 WDR97A6NE52 1622 aa39.34■■■■□ 3.89
RCE1-202ENST00000524506 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.28■■■■□ 3.88
RCE1-202ENST00000524506 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.28■■■■□ 3.88
RCE1-202ENST00000524506 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.25■■■■□ 3.87
RCE1-202ENST00000524506 GRIN2BQ13224 1484 aa39.2■■■■□ 3.87
RCE1-202ENST00000524506 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.18■■■■□ 3.86
RCE1-202ENST00000524506 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
RCE1-202ENST00000524506 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
RCE1-202ENST00000524506 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.11■■■■□ 3.85
RCE1-202ENST00000524506 ARAP1Q96P48 1450 aa39.09■■■■□ 3.85
RCE1-202ENST00000524506 PBRM1Q86U86 1689 aa39.05■■■■□ 3.84
RCE1-202ENST00000524506 SYNJ2O15056 1496 aa39.03■■■■□ 3.84
RCE1-202ENST00000524506 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.02■■■■□ 3.84
RCE1-202ENST00000524506 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
RCE1-202ENST00000524506 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.8■■■■□ 3.8
RCE1-202ENST00000524506 ADAMTS12P58397 1594 aa38.75■■■■□ 3.79
RCE1-202ENST00000524506 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.73■■■■□ 3.79
RCE1-202ENST00000524506 KIF27Q86VH2 1401 aa38.69■■■■□ 3.78
RCE1-202ENST00000524506 GRIN2AQ12879 1464 aa38.68■■■■□ 3.78
RCE1-202ENST00000524506 IGF1RP08069 1367 aa38.56■■■■□ 3.76
RCE1-202ENST00000524506 CEP170Q5SW79 1584 aa38.53■■■■□ 3.76
RCE1-202ENST00000524506 NUP160Q12769 1436 aa38.52■■■■□ 3.76
RCE1-202ENST00000524506 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.46■■■■□ 3.75
RCE1-202ENST00000524506 CUL7Q14999 1698 aa38.38■■■■□ 3.74
RCE1-202ENST00000524506 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.33■■■■□ 3.73
RCE1-202ENST00000524506 SHROOM2Q13796 1616 aa38.33■■■■□ 3.73
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