RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.84■■■■■ 6.21
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.02■■■■■ 4.8
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NACADO15069 1562 aa44.99■■■■■ 4.79
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.8■■■■■ 4.76
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.78■■■■■ 4.76
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SCRIBQ14160 1630 aa43.65■■■■■ 4.58
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.63■■■■■ 4.57
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.28■■■■■ 4.36
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.97■■■■■ 4.31
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMARCA2P51531 1590 aa41.51■■■■■ 4.24
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCAPD3P42695 1498 aa41.48■■■■■ 4.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.47■■■■■ 4.23
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.4■■■■■ 4.22
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HMGXB3Q12766 1538 aa41.34■■■■■ 4.21
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WIZO95785 1651 aa41.03■■■■■ 4.16
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.41■■■■■ 4.06
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.25■■■■■ 4.03
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.11■■■■■ 4.01
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.1■■■■■ 4.01
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM2Q13029 1718 aa39.83■■■■□ 3.97
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.81■■■■□ 3.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.78■■■■□ 3.96
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.7■■■■□ 3.95
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR62O43379 1518 aa39.59■■■■□ 3.93
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CUX1P39880 1505 aa38.91■■■■□ 3.82
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PBRM1Q86U86 1689 aa38.2■■■■□ 3.71
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.98■■■■□ 3.67
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.71■■■■□ 3.63
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SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGF1RP08069 1367 aa37.67■■■■□ 3.62
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUP160Q12769 1436 aa37.6■■■■□ 3.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGEF11O15085 1522 aa37.57■■■■□ 3.61
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP170Q5SW79 1584 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.57■■■■□ 3.6
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.5■■■■□ 3.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.47■■■■□ 3.59
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.34■■■■□ 3.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SHROOM2Q13796 1616 aa37.32■■■■□ 3.57
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.28■■■■□ 3.56
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARAP1Q96P48 1450 aa37.27■■■■□ 3.56
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