RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.18■■■■■ 6.26
SYF2-201ENST00000236273 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.03■■■■■ 5.28
SYF2-201ENST00000236273 ABCC9O60706 1549 aa46.97■■■■■ 5.11
SYF2-201ENST00000236273 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.17■■■■■ 4.82
SYF2-201ENST00000236273 NACADO15069 1562 aa45.17■■■■■ 4.82
SYF2-201ENST00000236273 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.17■■■■■ 4.82
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
SYF2-201ENST00000236273 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.96■■■■■ 4.79
SYF2-201ENST00000236273 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.82■■■■■ 4.77
SYF2-201ENST00000236273 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.23■■■■■ 4.67
SYF2-201ENST00000236273 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.97■■■■■ 4.63
SYF2-201ENST00000236273 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.93■■■■■ 4.62
SYF2-201ENST00000236273 SCRIBQ14160 1630 aa43.86■■■■■ 4.61
SYF2-201ENST00000236273 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.33■■■■■ 4.53
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.19■■■■■ 4.5
SYF2-201ENST00000236273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
SYF2-201ENST00000236273 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.49■■■■■ 4.39
SYF2-201ENST00000236273 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.25■■■■■ 4.35
SYF2-201ENST00000236273 SMARCA4P51532 1647 aa41.99■■■■■ 4.31
SYF2-201ENST00000236273 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
SYF2-201ENST00000236273 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.78■■■■■ 4.28
SYF2-201ENST00000236273 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.78■■■■■ 4.28
SYF2-201ENST00000236273 NCAPD3P42695 1498 aa41.74■■■■■ 4.27
SYF2-201ENST00000236273 SMARCA2P51531 1590 aa41.64■■■■■ 4.26
SYF2-201ENST00000236273 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.61■■■■■ 4.25
SYF2-201ENST00000236273 HMGXB3Q12766 1538 aa41.48■■■■■ 4.23
SYF2-201ENST00000236273 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.36■■■■■ 4.21
SYF2-201ENST00000236273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
SYF2-201ENST00000236273 WIZO95785 1651 aa41.32■■■■■ 4.2
SYF2-201ENST00000236273 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SYF2-201ENST00000236273 NESP48681 1621 aa40.73■■■■■ 4.11
SYF2-201ENST00000236273 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.55■■■■■ 4.08
SYF2-201ENST00000236273 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.52■■■■■ 4.08
SYF2-201ENST00000236273 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.42■■■■■ 4.06
SYF2-201ENST00000236273 ERCC6Q03468 1493 aa40.38■■■■■ 4.06
SYF2-201ENST00000236273 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
SYF2-201ENST00000236273 CFTRP13569 1480 aa40.3■■■■■ 4.04
SYF2-201ENST00000236273 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.27■■■■■ 4.04
SYF2-201ENST00000236273 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.18■■■■■ 4.02
SYF2-201ENST00000236273 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
SYF2-201ENST00000236273 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.02■■■■■ 4
SYF2-201ENST00000236273 CUX2O14529 1486 aa39.97■■■■□ 3.99
SYF2-201ENST00000236273 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.92■■■■□ 3.98
SYF2-201ENST00000236273 PRDM2Q13029 1718 aa39.91■■■■□ 3.98
SYF2-201ENST00000236273 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.86■■■■□ 3.97
SYF2-201ENST00000236273 WDR62O43379 1518 aa39.75■■■■□ 3.95
SYF2-201ENST00000236273 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
SYF2-201ENST00000236273 TOPBP1Q92547 1522 aa39.41■■■■□ 3.9
SYF2-201ENST00000236273 ABCC8Q09428 1581 aa39.35■■■■□ 3.89
SYF2-201ENST00000236273 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.33■■■■□ 3.89
SYF2-201ENST00000236273 CUX1P39880 1505 aa39.17■■■■□ 3.86
SYF2-201ENST00000236273 IFT140Q96RY7 1462 aa39.1■■■■□ 3.85
SYF2-201ENST00000236273 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
SYF2-201ENST00000236273 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
SYF2-201ENST00000236273 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.99■■■■□ 3.83
SYF2-201ENST00000236273 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.99■■■■□ 3.83
SYF2-201ENST00000236273 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.94■■■■□ 3.82
SYF2-201ENST00000236273 SOGA1O94964 1423 aa38.92■■■■□ 3.82
SYF2-201ENST00000236273 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.92■■■■□ 3.82
SYF2-201ENST00000236273 SYNJ1O43426 1573 aa38.86■■■■□ 3.81
SYF2-201ENST00000236273 TOP2BQ02880 1626 aa38.83■■■■□ 3.81
SYF2-201ENST00000236273 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.82■■■■□ 3.81
SYF2-201ENST00000236273 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.78■■■■□ 3.86e-7■■■□□ 18.7
SYF2-201ENST00000236273 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.72■■■■□ 3.79
SYF2-201ENST00000236273 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.72■■■■□ 3.79
SYF2-201ENST00000236273 WDR97A6NE52 1622 aa38.66■■■■□ 3.78
SYF2-201ENST00000236273 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.63■■■■□ 3.78
SYF2-201ENST00000236273 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.45■■■■□ 3.75
SYF2-201ENST00000236273 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.45■■■■□ 3.75
SYF2-201ENST00000236273 GRIN2BQ13224 1484 aa38.42■■■■□ 3.74
SYF2-201ENST00000236273 OSCARQ8IYS5 282 aa38.38■■■■□ 3.73
SYF2-201ENST00000236273 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.36■■■■□ 3.73
SYF2-201ENST00000236273 PBRM1Q86U86 1689 aa38.34■■■■□ 3.73
SYF2-201ENST00000236273 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
SYF2-201ENST00000236273 CHD1O14646 1710 aa38.26■■■■□ 3.72
SYF2-201ENST00000236273 FBLN2P98095 1184 aa38.2■■■■□ 3.71
SYF2-201ENST00000236273 SYNJ2O15056 1496 aa38.16■■■■□ 3.7
SYF2-201ENST00000236273 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.7
SYF2-201ENST00000236273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.13■■■■□ 3.7
SYF2-201ENST00000236273 KIF27Q86VH2 1401 aa38.07■■■■□ 3.69
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS12P58397 1594 aa38.05■■■■□ 3.68
SYF2-201ENST00000236273 TRIM41Q8WV44 630 aa38.05■■■■□ 3.68
SYF2-201ENST00000236273 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.01■■■■□ 3.68
SYF2-201ENST00000236273 IGF1RP08069 1367 aa38.01■■■■□ 3.68
SYF2-201ENST00000236273 GRIN2AQ12879 1464 aa37.95■■■■□ 3.67
SYF2-201ENST00000236273 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.89■■■■□ 3.66
SYF2-201ENST00000236273 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.89■■■■□ 3.66
SYF2-201ENST00000236273 NUP160Q12769 1436 aa37.81■■■■□ 3.64
SYF2-201ENST00000236273 CEP170Q5SW79 1584 aa37.77■■■■□ 3.64
SYF2-201ENST00000236273 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.77■■■■□ 3.64
SYF2-201ENST00000236273 CUL7Q14999 1698 aa37.77■■■■□ 3.64
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF11O15085 1522 aa37.75■■■■□ 3.63
SYF2-201ENST00000236273 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
SYF2-201ENST00000236273 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
SYF2-201ENST00000236273 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
SYF2-201ENST00000236273 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.73■■■■□ 3.63
SYF2-201ENST00000236273 SHROOM2Q13796 1616 aa37.49■■■■□ 3.59
SYF2-201ENST00000236273 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.49■■■■□ 3.59
SYF2-201ENST00000236273 ARAP1Q96P48 1450 aa37.47■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms