Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 AC138894.1-209ENST00000637299 1954 ntTSL 518.22■□□□□ 0.511e-7■■■□□ 15.8
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SND1Q7KZF4 RBBP4-207ENST00000460669 783 ntTSL 56.15□□□□□ -1.421e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 RBBP4-210ENST00000475321 619 ntTSL 55.33□□□□□ -1.561e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.039e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 TXNDC12-204ENST00000472624 800 ntTSL 514.1□□□□□ -0.159e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.261e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 512.45□□□□□ -0.421e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.214e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.494e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 SQLE-203ENST00000518931 554 ntTSL 49.51□□□□□ -0.893e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 PRCP-218ENST00000534631 783 ntTSL 515.11■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 PRCP-206ENST00000527444 845 ntTSL 38.59□□□□□ -1.034e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 GAA-207ENST00000573556 756 ntTSL 219.9■□□□□ 0.786e-8■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.435e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 CANT1-214ENST00000592228 1546 ntTSL 515.31■□□□□ 0.045e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 CANT1-216ENST00000620915 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.335e-7■■■□□ 15.7
SND1Q7KZF4 CANT1-201ENST00000302345 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.335e-7■■■□□ 15.7
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