RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591304.1

CLPTM1-212, Transcript of CLPTM1, transmembrane protein, humanhuman

TSL 4

Gene CLPTM1, Length 528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1-212ENST00000591304 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.04■■■■■ 6.72
CLPTM1-212ENST00000591304 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.95■■■■■ 5.75
CLPTM1-212ENST00000591304 ABCC9O60706 1549 aa50.05■■■■■ 5.6
CLPTM1-212ENST00000591304 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.11■■■■■ 5.29
CLPTM1-212ENST00000591304 NACADO15069 1562 aa47.97■■■■■ 5.27
CLPTM1-212ENST00000591304 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.77■■■■■ 5.24
CLPTM1-212ENST00000591304 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.6■■■■■ 5.21
CLPTM1-212ENST00000591304 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
CLPTM1-212ENST00000591304 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.24■■■■■ 5.15
CLPTM1-212ENST00000591304 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.97■■■■■ 5.11
CLPTM1-212ENST00000591304 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.68■■■■■ 5.06
CLPTM1-212ENST00000591304 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.56■■■■■ 5.04
CLPTM1-212ENST00000591304 SCRIBQ14160 1630 aa46.32■■■■■ 5.01
CLPTM1-212ENST00000591304 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.19■■■■■ 4.99
CLPTM1-212ENST00000591304 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.19■■■■■ 4.98
CLPTM1-212ENST00000591304 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
CLPTM1-212ENST00000591304 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.3■■■■■ 4.84
CLPTM1-212ENST00000591304 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.04■■■■■ 4.8
CLPTM1-212ENST00000591304 SMARCA4P51532 1647 aa44.33■■■■■ 4.69
CLPTM1-212ENST00000591304 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.27■■■■■ 4.68
CLPTM1-212ENST00000591304 NCAPD3P42695 1498 aa44.24■■■■■ 4.67
CLPTM1-212ENST00000591304 SMARCA2P51531 1590 aa44.17■■■■■ 4.66
CLPTM1-212ENST00000591304 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.16■■■■■ 4.66
CLPTM1-212ENST00000591304 HMGXB3Q12766 1538 aa43.99■■■■■ 4.63
CLPTM1-212ENST00000591304 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.94■■■■■ 4.62
CLPTM1-212ENST00000591304 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.89■■■■■ 4.62
CLPTM1-212ENST00000591304 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
CLPTM1-212ENST00000591304 WIZO95785 1651 aa43.42■■■■■ 4.54
CLPTM1-212ENST00000591304 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
CLPTM1-212ENST00000591304 ERCC6Q03468 1493 aa43.23■■■■■ 4.51
CLPTM1-212ENST00000591304 NESP48681 1621 aa43.17■■■■■ 4.5
CLPTM1-212ENST00000591304 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.16■■■■■ 4.5
CLPTM1-212ENST00000591304 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CLPTM1-212ENST00000591304 CUX2O14529 1486 aa42.94■■■■■ 4.46
CLPTM1-212ENST00000591304 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.91■■■■■ 4.46
CLPTM1-212ENST00000591304 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.88■■■■■ 4.45
CLPTM1-212ENST00000591304 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.73■■■■■ 4.43
CLPTM1-212ENST00000591304 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
CLPTM1-212ENST00000591304 CFTRP13569 1480 aa42.58■■■■■ 4.41
CLPTM1-212ENST00000591304 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.44■■■■■ 4.38
CLPTM1-212ENST00000591304 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.42■■■■■ 4.38
CLPTM1-212ENST00000591304 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.41■■■■■ 4.38
CLPTM1-212ENST00000591304 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.41■■■■■ 4.38
CLPTM1-212ENST00000591304 PRDM2Q13029 1718 aa42.32■■■■■ 4.36
CLPTM1-212ENST00000591304 WDR62O43379 1518 aa42.29■■■■■ 4.36
CLPTM1-212ENST00000591304 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.99■■■■■ 4.31
CLPTM1-212ENST00000591304 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
CLPTM1-212ENST00000591304 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
CLPTM1-212ENST00000591304 ABCC8Q09428 1581 aa41.79■■■■■ 4.28
CLPTM1-212ENST00000591304 TOPBP1Q92547 1522 aa41.69■■■■■ 4.26
CLPTM1-212ENST00000591304 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.63■■■■■ 4.26
CLPTM1-212ENST00000591304 IFT140Q96RY7 1462 aa41.54■■■■■ 4.24
CLPTM1-212ENST00000591304 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
CLPTM1-212ENST00000591304 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
CLPTM1-212ENST00000591304 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.26■■■■■ 4.2
CLPTM1-212ENST00000591304 CUX1P39880 1505 aa41.21■■■■■ 4.19
CLPTM1-212ENST00000591304 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
CLPTM1-212ENST00000591304 SOGA1O94964 1423 aa41.15■■■■■ 4.18
CLPTM1-212ENST00000591304 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.15■■■■■ 4.18
CLPTM1-212ENST00000591304 OSCARQ8IYS5 282 aa41.1■■■■■ 4.17
CLPTM1-212ENST00000591304 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.08■■■■■ 4.17
CLPTM1-212ENST00000591304 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.04■■■■■ 4.162e-14■■■■■ 61.8
CLPTM1-212ENST00000591304 WDR97A6NE52 1622 aa41.03■■■■■ 4.16
CLPTM1-212ENST00000591304 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
CLPTM1-212ENST00000591304 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.85■■■■■ 4.13
CLPTM1-212ENST00000591304 TOP2BQ02880 1626 aa40.82■■■■■ 4.13
CLPTM1-212ENST00000591304 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.82■■■■■ 4.13
CLPTM1-212ENST00000591304 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.76■■■■■ 4.12
CLPTM1-212ENST00000591304 CHD1O14646 1710 aa40.74■■■■■ 4.11
CLPTM1-212ENST00000591304 GRIN2BQ13224 1484 aa40.73■■■■■ 4.11
CLPTM1-212ENST00000591304 SYNJ1O43426 1573 aa40.73■■■■■ 4.11
CLPTM1-212ENST00000591304 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.68■■■■■ 4.1
CLPTM1-212ENST00000591304 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
CLPTM1-212ENST00000591304 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.66■■■■■ 4.1
CLPTM1-212ENST00000591304 FBLN2P98095 1184 aa40.65■■■■■ 4.1
CLPTM1-212ENST00000591304 PBRM1Q86U86 1689 aa40.62■■■■■ 4.09
CLPTM1-212ENST00000591304 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.62■■■■■ 4.09
CLPTM1-212ENST00000591304 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
CLPTM1-212ENST00000591304 SYNJ2O15056 1496 aa40.5■■■■■ 4.07
CLPTM1-212ENST00000591304 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
CLPTM1-212ENST00000591304 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
CLPTM1-212ENST00000591304 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.42■■■■■ 4.06
CLPTM1-212ENST00000591304 TRIM41Q8WV44 630 aa40.41■■■■■ 4.06
CLPTM1-212ENST00000591304 ARHGEF11O15085 1522 aa40.37■■■■■ 4.05
CLPTM1-212ENST00000591304 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.3■■■■■ 4.04
CLPTM1-212ENST00000591304 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.27■■■■■ 4.04
CLPTM1-212ENST00000591304 ADAMTS12P58397 1594 aa40.25■■■■■ 4.03
CLPTM1-212ENST00000591304 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.2■■■■■ 4.03
CLPTM1-212ENST00000591304 GRIN2AQ12879 1464 aa40.19■■■■■ 4.02
CLPTM1-212ENST00000591304 KIF27Q86VH2 1401 aa40.08■■■■■ 4.01
CLPTM1-212ENST00000591304 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.02■■■■■ 4
CLPTM1-212ENST00000591304 NUP160Q12769 1436 aa40.01■■■■■ 4
CLPTM1-212ENST00000591304 ARAP1Q96P48 1450 aa39.99■■■■□ 3.99
CLPTM1-212ENST00000591304 CEP170Q5SW79 1584 aa39.96■■■■□ 3.99
CLPTM1-212ENST00000591304 IGF1RP08069 1367 aa39.89■■■■□ 3.98
CLPTM1-212ENST00000591304 CUL7Q14999 1698 aa39.89■■■■□ 3.98
CLPTM1-212ENST00000591304 SHROOM2Q13796 1616 aa39.77■■■■□ 3.96
CLPTM1-212ENST00000591304 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.68■■■■□ 3.94
CLPTM1-212ENST00000591304 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.66■■■■□ 3.94
CLPTM1-212ENST00000591304 JPH4Q96JJ6 628 aa39.62■■■■□ 3.93
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