Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 521.66■■□□□ 1.061e-10■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 219.91■□□□□ 0.781e-10■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 218.07■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-10■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-10■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 TFRC-211ENST00000475593 875 ntTSL 35.61□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 TFRC-206ENST00000463047 549 ntTSL 24.57□□□□□ -1.682e-6■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 WEE1-206ENST00000530175 838 ntTSL 34.52□□□□□ -1.692e-6■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 WEE1-207ENST00000530712 990 ntTSL 23.7□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 WEE1-204ENST00000524612 573 ntTSL 43.1□□□□□ -1.912e-6■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 30.82□□□□□ -2.282e-6■■■■■ 27.6
RBM22Q9NW64 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.211e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 416.27■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-219ENST00000496452 853 ntTSL 216.27■□□□□ 0.21e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-213ENST00000481650 549 ntTSL 413.79□□□□□ -0.21e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-210ENST00000474809 915 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.571e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.621e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.881e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-211ENST00000477044 904 ntTSL 57.8□□□□□ -1.161e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.241e-10■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 519.77■□□□□ 0.752e-16■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-16■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.672e-16■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-16■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 CDK1-205ENST00000475504 1720 ntTSL 27.36□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 27.5
RBM22Q9NW64 RRBP1-209ENST00000495501 832 ntTSL 520.23■□□□□ 0.835e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.549e-7■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.071e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-212ENST00000638230 1922 ntTSL 512.21□□□□□ -0.451e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-202ENST00000366525 2851 ntTSL 59.58□□□□□ -0.881e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-222ENST00000639880 4239 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 HNRNPU-213ENST00000638301 3650 ntTSL 56.72□□□□□ -1.331e-13■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 FN1-220ENST00000480024 576 ntTSL 26.65□□□□□ -1.345e-24■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 RPLP1-204ENST00000488122 940 ntTSL 221.04■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 27.4
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RBM22Q9NW64 RPLP1-201ENST00000260379 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 RPL9-207ENST00000506581 371 ntTSL 52.09□□□□□ -2.073e-10■■■■■ 27.4
RBM22Q9NW64 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 NPTN-208ENST00000565282 1247 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.38e-8■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 NPTN-207ENST00000564551 586 ntTSL 314.33□□□□□ -0.128e-8■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.438e-8■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 510.01□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.218e-11■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 RNF4-213ENST00000509388 569 ntTSL 315.09■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 RNF4-202ENST00000502316 855 ntTSL 214.36□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 333.34■■■□□ 2.937e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.57e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.37e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 ORC6-207ENST00000569239 1833 ntTSL 222.04■■□□□ 1.127e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TMEM184A-211ENST00000474813 1008 ntTSL 321.47■■□□□ 1.037e-7■■■■■ 27.3
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RBM22Q9NW64 TMEM184A-205ENST00000421923 744 ntTSL 521.08■□□□□ 0.977e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-213ENST00000557485 491 ntTSL 319.5■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-209ENST00000556094 785 ntTSL 318.09■□□□□ 0.497e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TMEM184A-208ENST00000441933 640 ntTSL 518.04■□□□□ 0.487e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.457e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TSNARE1-207ENST00000521825 346 ntTSL 317.81■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 ORC6-202ENST00000563306 1190 ntTSL 217.79■□□□□ 0.447e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 ORC6-208ENST00000570260 561 ntTSL 216.58■□□□□ 0.247e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.217e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TMEM184A-202ENST00000319010 866 ntTSL 516.11■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 EGF-207ENST00000509996 1464 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 BRF1-220ENST00000552127 778 ntTSL 415.4■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 IFT140-204ENST00000439987 2580 ntTSL 215.22■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TMEM184A-203ENST00000319018 4374 ntTSL 515.17■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 07e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 27.3
RBM22Q9NW64 TMEM184A-204ENST00000414730 574 ntTSL 314.99□□□□□ -0.017e-7■■■■■ 27.3
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