Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 215.97■□□□□ 0.154e-37■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.344e-37■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-37■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-37■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.758e-19■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.381e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.241e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-208ENST00000600964 458 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.781e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 AP2S1-209ENST00000601498 898 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.092e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.812e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.792e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.632e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 A2M-210ENST00000542567 563 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-52■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-214ENST00000514495 564 ntTSL 230.26■■■□□ 2.434e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.434e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.914e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-217ENST00000515399 985 ntTSL 321.52■■□□□ 1.044e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-208ENST00000506180 843 ntTSL 520.02■□□□□ 0.84e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-213ENST00000514210 856 ntTSL 216.4■□□□□ 0.224e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CTBP1-212ENST00000513420 704 ntTSL 316.1■□□□□ 0.174e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.348e-11■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-10■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 C3-207ENST00000596238 563 ntTSL 28.25□□□□□ -1.091e-48■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-202ENST00000344391 1619 ntTSL 1 (best)17.78■□□□□ 0.444e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-206ENST00000403136 1778 ntTSL 1 (best)14.63□□□□□ -0.074e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-205ENST00000377806 1773 ntTSL 1 (best)14.02□□□□□ -0.164e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-204ENST00000358394 1484 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.854e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.184e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.194e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.194e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.284e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.425e-26■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.955e-26■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.745e-26■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)15.9■□□□□ 0.145e-26■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.69□□□□□ -0.75e-26■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.051e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.331e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.291e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 U2SURP-205ENST00000467348 1267 ntTSL 56.96□□□□□ -1.31e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.491e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.671e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.76□□□□□ -1.971e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CCT6A-203ENST00000462133 665 ntTSL 312.03□□□□□ -0.481e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 CCT6A-204ENST00000466479 745 ntTSL 28.31□□□□□ -1.081e-8■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.591e-323■□□□□ 10.1
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NOLC1Q14978 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 LMAN2-207ENST00000514458 616 ntTSL 522.61■■□□□ 1.212e-6■□□□□ 10.1
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NOLC1Q14978 LMAN2-205ENST00000506310 564 ntTSL 415.63■□□□□ 0.092e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.057e-7■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-206ENST00000559075 1735 ntTSL 223.42■■□□□ 1.341e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-213ENST00000560309 633 ntTSL 322.57■■□□□ 1.21e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-207ENST00000559386 893 ntTSL 522.41■■□□□ 1.181e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-215ENST00000560595 917 ntTSL 1 (best)22.41■■□□□ 1.181e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.851e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-211ENST00000560044 1054 ntTSL 520.21■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 ETFA-218ENST00000560899 910 ntTSL 518.91■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.12e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SLC38A2-211ENST00000552414 566 ntTSL 37.31□□□□□ -1.244e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.953e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 517.81■□□□□ 0.443e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-214ENST00000455548 547 ntTSL 317.81■□□□□ 0.443e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.328e-34■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-215ENST00000457039 940 ntTSL 515.47■□□□□ 0.073e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 215.16■□□□□ 0.028e-34■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-209ENST00000439886 3371 ntTSL 214.17□□□□□ -0.143e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.183e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 313.69□□□□□ -0.223e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.38e-34■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-218ENST00000482171 4298 ntTSL 213.18□□□□□ -0.33e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-212ENST00000451542 796 ntTSL 513.18□□□□□ -0.33e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 413.07□□□□□ -0.323e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.393e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 512.52□□□□□ -0.413e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.473e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 210.6□□□□□ -0.713e-9■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.078e-34■□□□□ 10.1
NOLC1Q14978 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.711e-323■□□□□ 10
NOLC1Q14978 DANCR-202ENST00000425653 823 ntTSL 1 (best)18.25■□□□□ 0.511e-323■□□□□ 10
NOLC1Q14978 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.54□□□□□ -21e-323■□□□□ 10
NOLC1Q14978 FGB-203ENST00000473984 665 ntTSL 210.95□□□□□ -0.663e-9■□□□□ 10
NOLC1Q14978 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.986e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.916e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.76e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.576e-11■□□□□ 10
NOLC1Q14978 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.496e-11■□□□□ 10
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