RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599990.5

AP2S1-207, Transcript of adaptor related protein complex 2 subunit sigma 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene AP2S1, Length 829 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1-207ENST00000599990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.29■■■■■ 5.64
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AP2S1-207ENST00000599990 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
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AP2S1-207ENST00000599990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.84■■■■■ 4.29
AP2S1-207ENST00000599990 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.74■■■■■ 4.27
AP2S1-207ENST00000599990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.71■■■■■ 4.27
AP2S1-207ENST00000599990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.66■■■■■ 4.26
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AP2S1-207ENST00000599990 SCRIBQ14160 1630 aa40.71■■■■■ 4.11
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AP2S1-207ENST00000599990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
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AP2S1-207ENST00000599990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.25■■■■□ 3.87
AP2S1-207ENST00000599990 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.13■■■■□ 3.85
AP2S1-207ENST00000599990 SMARCA4P51532 1647 aa39■■■■□ 3.83
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AP2S1-207ENST00000599990 SMARCA2P51531 1590 aa38.65■■■■□ 3.78
AP2S1-207ENST00000599990 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.63■■■■□ 3.77
AP2S1-207ENST00000599990 NCAPD3P42695 1498 aa38.61■■■■□ 3.77
AP2S1-207ENST00000599990 HMGXB3Q12766 1538 aa38.49■■■■□ 3.75
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AP2S1-207ENST00000599990 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.57■■■■□ 3.6
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AP2S1-207ENST00000599990 CFTRP13569 1480 aa37.33■■■■□ 3.57
AP2S1-207ENST00000599990 ERCC6Q03468 1493 aa37.3■■■■□ 3.56
AP2S1-207ENST00000599990 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.24■■■■□ 3.55
AP2S1-207ENST00000599990 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.22■■■■□ 3.55
AP2S1-207ENST00000599990 PRDM2Q13029 1718 aa37.18■■■■□ 3.54
AP2S1-207ENST00000599990 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.06■■■■□ 3.52
AP2S1-207ENST00000599990 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
AP2S1-207ENST00000599990 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.99■■■■□ 3.51
AP2S1-207ENST00000599990 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.89■■■■□ 3.5
AP2S1-207ENST00000599990 CUX2O14529 1486 aa36.87■■■■□ 3.49
AP2S1-207ENST00000599990 WDR62O43379 1518 aa36.8■■■■□ 3.48
AP2S1-207ENST00000599990 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
AP2S1-207ENST00000599990 TOPBP1Q92547 1522 aa36.52■■■■□ 3.44
AP2S1-207ENST00000599990 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.52■■■■□ 3.44
AP2S1-207ENST00000599990 ABCC8Q09428 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
AP2S1-207ENST00000599990 CUX1P39880 1505 aa36.35■■■■□ 3.41
AP2S1-207ENST00000599990 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
AP2S1-207ENST00000599990 IFT140Q96RY7 1462 aa36.2■■■■□ 3.39
AP2S1-207ENST00000599990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.38
AP2S1-207ENST00000599990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.17■■■■□ 3.38
AP2S1-207ENST00000599990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.16■■■■□ 3.38
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AP2S1-207ENST00000599990 SYNJ1O43426 1573 aa36.14■■■■□ 3.38
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AP2S1-207ENST00000599990 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.04■■■■□ 3.36
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AP2S1-207ENST00000599990 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
AP2S1-207ENST00000599990 WDR97A6NE52 1622 aa35.96■■■■□ 3.35
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AP2S1-207ENST00000599990 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.84■■■■□ 3.33
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AP2S1-207ENST00000599990 CHD1O14646 1710 aa35.45■■■■□ 3.27
AP2S1-207ENST00000599990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.42■■■■□ 3.26
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AP2S1-207ENST00000599990 ADAMTS12P58397 1594 aa35.35■■■■□ 3.25
AP2S1-207ENST00000599990 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.34■■■■□ 3.25
AP2S1-207ENST00000599990 OSCARQ8IYS5 282 aa35.29■■■■□ 3.24
AP2S1-207ENST00000599990 FBLN2P98095 1184 aa35.24■■■■□ 3.23
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AP2S1-207ENST00000599990 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.21■■■■□ 3.23
AP2S1-207ENST00000599990 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
AP2S1-207ENST00000599990 IGF1RP08069 1367 aa35.21■■■■□ 3.23
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AP2S1-207ENST00000599990 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.17■■■■□ 3.22
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AP2S1-207ENST00000599990 EEA1Q15075 1411 aa34.9■■■■□ 3.18
AP2S1-207ENST00000599990 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.84■■■■□ 3.17
AP2S1-207ENST00000599990 ARHGEF11O15085 1522 aa34.81■■■■□ 3.16
AP2S1-207ENST00000599990 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
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AP2S1-207ENST00000599990 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.81■■■■□ 3.16
AP2S1-207ENST00000599990 PRXQ9BXM0 1461 aa34.81■■■■□ 3.16
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