Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HMGB1P1B2RPK0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HMGB1P1B2RPK0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms