RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419348.6

HTATIP2-201, Transcript of HIV-1 Tat interactive protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HTATIP2, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATIP2-201ENST00000419348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.79■■■■■ 6.04
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.77■■■■■ 5.08
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCC9O60706 1549 aa46.45■■■■■ 5.03
HTATIP2-201ENST00000419348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.25■■■■■ 4.67
HTATIP2-201ENST00000419348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.12■■■■■ 4.65
HTATIP2-201ENST00000419348 NACADO15069 1562 aa44.04■■■■■ 4.64
HTATIP2-201ENST00000419348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
HTATIP2-201ENST00000419348 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.82■■■■■ 4.6
HTATIP2-201ENST00000419348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.7■■■■■ 4.59
HTATIP2-201ENST00000419348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.47■■■■■ 4.55
HTATIP2-201ENST00000419348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.41■■■■■ 4.54
HTATIP2-201ENST00000419348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.05■■■■■ 4.48
HTATIP2-201ENST00000419348 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.93■■■■■ 4.46
HTATIP2-201ENST00000419348 SCRIBQ14160 1630 aa42.69■■■■■ 4.42
HTATIP2-201ENST00000419348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.4■■■■■ 4.38
HTATIP2-201ENST00000419348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.89■■■■■ 4.3
HTATIP2-201ENST00000419348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
HTATIP2-201ENST00000419348 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.82■■■■■ 4.29
HTATIP2-201ENST00000419348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
HTATIP2-201ENST00000419348 SMARCA4P51532 1647 aa40.87■■■■■ 4.13
HTATIP2-201ENST00000419348 NCAPD3P42695 1498 aa40.74■■■■■ 4.11
HTATIP2-201ENST00000419348 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.67■■■■■ 4.1
HTATIP2-201ENST00000419348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.65■■■■■ 4.1
HTATIP2-201ENST00000419348 SMARCA2P51531 1590 aa40.6■■■■■ 4.09
HTATIP2-201ENST00000419348 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.49■■■■■ 4.07
HTATIP2-201ENST00000419348 HMGXB3Q12766 1538 aa40.38■■■■■ 4.06
HTATIP2-201ENST00000419348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
HTATIP2-201ENST00000419348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
HTATIP2-201ENST00000419348 WIZO95785 1651 aa40.21■■■■■ 4.03
HTATIP2-201ENST00000419348 ERCC6Q03468 1493 aa40.09■■■■■ 4.01
HTATIP2-201ENST00000419348 NESP48681 1621 aa39.95■■■■□ 3.99
HTATIP2-201ENST00000419348 CUX2O14529 1486 aa39.91■■■■□ 3.98
HTATIP2-201ENST00000419348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
HTATIP2-201ENST00000419348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.76■■■■□ 3.96
HTATIP2-201ENST00000419348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.67■■■■□ 3.94
HTATIP2-201ENST00000419348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.56■■■■□ 3.92
HTATIP2-201ENST00000419348 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.55■■■■□ 3.92
HTATIP2-201ENST00000419348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
HTATIP2-201ENST00000419348 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.39■■■■□ 3.9
HTATIP2-201ENST00000419348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.27■■■■□ 3.88
HTATIP2-201ENST00000419348 CFTRP13569 1480 aa39.24■■■■□ 3.87
HTATIP2-201ENST00000419348 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.12■■■■□ 3.85
HTATIP2-201ENST00000419348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.03■■■■□ 3.84
HTATIP2-201ENST00000419348 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.02■■■■□ 3.84
HTATIP2-201ENST00000419348 WDR62O43379 1518 aa38.96■■■■□ 3.83
HTATIP2-201ENST00000419348 PRDM2Q13029 1718 aa38.85■■■■□ 3.81
HTATIP2-201ENST00000419348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCC8Q09428 1581 aa38.42■■■■□ 3.74
HTATIP2-201ENST00000419348 TOPBP1Q92547 1522 aa38.35■■■■□ 3.73
HTATIP2-201ENST00000419348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.31■■■■□ 3.72
HTATIP2-201ENST00000419348 OSCARQ8IYS5 282 aa38.31■■■■□ 3.72
HTATIP2-201ENST00000419348 IFT140Q96RY7 1462 aa38.26■■■■□ 3.72
HTATIP2-201ENST00000419348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
HTATIP2-201ENST00000419348 CUX1P39880 1505 aa38.13■■■■□ 3.69
HTATIP2-201ENST00000419348 TRIM41Q8WV44 630 aa38.09■■■■□ 3.69
HTATIP2-201ENST00000419348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
HTATIP2-201ENST00000419348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.68
HTATIP2-201ENST00000419348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.98■■■■□ 3.67
HTATIP2-201ENST00000419348 SOGA1O94964 1423 aa37.94■■■■□ 3.66
HTATIP2-201ENST00000419348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.9■■■■□ 3.661e-6■■■■■ 33.8
HTATIP2-201ENST00000419348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
HTATIP2-201ENST00000419348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.88■■■■□ 3.65
HTATIP2-201ENST00000419348 TOP2BQ02880 1626 aa37.87■■■■□ 3.65
HTATIP2-201ENST00000419348 SYNJ1O43426 1573 aa37.84■■■■□ 3.65
HTATIP2-201ENST00000419348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
HTATIP2-201ENST00000419348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.83■■■■□ 3.65
HTATIP2-201ENST00000419348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
HTATIP2-201ENST00000419348 FBLN2P98095 1184 aa37.7■■■■□ 3.63
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.65■■■■□ 3.62
HTATIP2-201ENST00000419348 WDR97A6NE52 1622 aa37.62■■■■□ 3.61
HTATIP2-201ENST00000419348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.52■■■■□ 3.6
HTATIP2-201ENST00000419348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.52■■■■□ 3.6
HTATIP2-201ENST00000419348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.52■■■■□ 3.6
HTATIP2-201ENST00000419348 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.49■■■■□ 3.59
HTATIP2-201ENST00000419348 ARHGEF11O15085 1522 aa37.49■■■■□ 3.59
HTATIP2-201ENST00000419348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
HTATIP2-201ENST00000419348 GRIN2BQ13224 1484 aa37.45■■■■□ 3.59
HTATIP2-201ENST00000419348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.45■■■■□ 3.59
HTATIP2-201ENST00000419348 CHD1O14646 1710 aa37.45■■■■□ 3.59
HTATIP2-201ENST00000419348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.41■■■■□ 3.58
HTATIP2-201ENST00000419348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.39■■■■□ 3.58
HTATIP2-201ENST00000419348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.37■■■■□ 3.57
HTATIP2-201ENST00000419348 PBRM1Q86U86 1689 aa37.29■■■■□ 3.56
HTATIP2-201ENST00000419348 SYNJ2O15056 1496 aa37.26■■■■□ 3.56
HTATIP2-201ENST00000419348 KIF27Q86VH2 1401 aa37.22■■■■□ 3.55
HTATIP2-201ENST00000419348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.2■■■■□ 3.55
HTATIP2-201ENST00000419348 ARAP1Q96P48 1450 aa37.15■■■■□ 3.54
HTATIP2-201ENST00000419348 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.13■■■■□ 3.53
HTATIP2-201ENST00000419348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.07■■■■□ 3.52
HTATIP2-201ENST00000419348 IGF1RP08069 1367 aa37.06■■■■□ 3.52
HTATIP2-201ENST00000419348 ADAMTS12P58397 1594 aa37.04■■■■□ 3.52
HTATIP2-201ENST00000419348 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.01■■■■□ 3.52
HTATIP2-201ENST00000419348 GRIN2AQ12879 1464 aa36.95■■■■□ 3.51
HTATIP2-201ENST00000419348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.91■■■■□ 3.5
HTATIP2-201ENST00000419348 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
HTATIP2-201ENST00000419348 CUL7Q14999 1698 aa36.86■■■■□ 3.49
HTATIP2-201ENST00000419348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.84■■■■□ 3.49
HTATIP2-201ENST00000419348 NUP160Q12769 1436 aa36.81■■■■□ 3.48
HTATIP2-201ENST00000419348 CEP170Q5SW79 1584 aa36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms