Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TPM3-213ENST00000368545 2147 ntTSL 1 (best)9.4□□□□□ -0.91e-11■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 313.78□□□□□ -0.25e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 211.8□□□□□ -0.525e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-212ENST00000482069 539 ntTSL 311.73□□□□□ -0.535e-44■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-44■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 RPS24-213ENST00000485708 544 ntTSL 25.2□□□□□ -1.585e-44■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 ZCCHC9-208ENST00000507402 768 ntTSL 212.78□□□□□ -0.368e-7■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.548e-7■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.864e-9■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.874e-9■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.178e-8■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.348e-8■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 215.59■□□□□ 0.096e-50■■□□□ 11.7
PUM1Q14671 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.016e-50■■□□□ 11.7
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PUM1Q14671 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.422e-10■■□□□ 11.6
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PUM1Q14671 NOP56-217ENST00000494697 919 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-10■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 EIF3G-209ENST00000589674 596 ntTSL 213.42□□□□□ -0.267e-12■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 EIF3G-214ENST00000593066 590 ntTSL 513.31□□□□□ -0.287e-12■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 NOP56-218ENST00000496775 729 ntTSL 212.73□□□□□ -0.372e-10■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 PRC1-206ENST00000555455 830 ntTSL 312.68□□□□□ -0.382e-10■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 EIF3G-215ENST00000593095 636 ntTSL 312.49□□□□□ -0.417e-12■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 PRC1-217ENST00000560423 755 ntTSL 36.76□□□□□ -1.332e-10■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.913e-6■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 EIF3G-213ENST00000593054 453 ntTSL 511.64□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-8■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 XPC-207ENST00000511155 557 ntTSL 48.45□□□□□ -1.067e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 XPC-204ENST00000455144 958 ntTSL 47.29□□□□□ -1.247e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 XPC-203ENST00000452172 571 ntTSL 43.93□□□□□ -1.787e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.14e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.14e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 UTP6-202ENST00000477128 2344 ntTSL 26.58□□□□□ -1.364e-6■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.34e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 11.6
PUM1Q14671 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.664e-7■■□□□ 11.6
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