Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGY1

NOL12, Nucleolar protein 12, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 COLGALT1-206ENST00000601354 546 ntTSL 512.63□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-212ENST00000496082 698 ntTSL 412.41□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.461e-25■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.513e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RECQL5-213ENST00000581825 793 ntTSL 311.54□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.623e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.653e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ATP13A1-206ENST00000471063 373 ntTSL 29.51□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 COLGALT1-205ENST00000600474 552 ntTSL 49.37□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-219ENST00000529907 826 ntTSL 59.3□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)7.92□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.63e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-216ENST00000529172 500 ntTSL 24.83□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-207ENST00000525050 513 ntTSL 34.83□□□□□ -1.643e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.651e-25■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 PPP6R3-213ENST00000527069 573 ntTSL 54.04□□□□□ -1.763e-6■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.541e-25■■■■□ 21.5
NOL12Q9UGY1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 21.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.77■□□□□ 0.442e-6■■■■□ 21.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 21.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 21.2
NOL12Q9UGY1 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 21.1
NOL12Q9UGY1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.923e-47■■■■□ 21
NOL12Q9UGY1 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.467e-11■■■■□ 20.4
NOL12Q9UGY1 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 514.25□□□□□ -0.137e-11■■■■□ 20.4
NOL12Q9UGY1 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.028e-6■■■■□ 20.4
NOL12Q9UGY1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.111e-323■■■■□ 20.3
NOL12Q9UGY1 OBSL1-209ENST00000465589 571 ntTSL 317.57■□□□□ 0.42e-15■■■■□ 20.3
NOL12Q9UGY1 OBSL1-212ENST00000491370 584 ntTSL 416.72■□□□□ 0.272e-15■■■■□ 20.3
NOL12Q9UGY1 RTEL1-210ENST00000496816 2222 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.134e-6■■■■□ 20.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 14e-6■■■■□ 20.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 220.65■□□□□ 0.94e-6■■■■□ 20.2
NOL12Q9UGY1 RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 5751 ntTSL 219.66■□□□□ 0.744e-6■■■■□ 20.2
NOL12Q9UGY1 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.093e-6■■■■□ 20.2
NOL12Q9UGY1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.286e-7■■■■□ 20.1
NOL12Q9UGY1 A1BG-202ENST00000595014 2301 ntTSL 221.14■□□□□ 0.976e-7■■■■□ 20.1
NOL12Q9UGY1 AC012313.3-201ENST00000600123 1765 ntTSL 1 (best)20.21■□□□□ 0.836e-7■■■■□ 20.1
NOL12Q9UGY1 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)24.26■■□□□ 1.473e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.43e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.13e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-207ENST00000530875 1922 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.043e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-210ENST00000531579 590 ntTSL 414.08□□□□□ -0.163e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 AP1G2-224ENST00000556741 353 ntTSL 212□□□□□ -0.493e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-208ENST00000531131 1023 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.673e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NXF1-203ENST00000526163 569 ntTSL 410.85□□□□□ -0.673e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 AP1G2-222ENST00000556152 673 ntTSL 310.45□□□□□ -0.743e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 AP1G2-215ENST00000554977 569 ntTSL 49.59□□□□□ -0.873e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 NFE2L1-212ENST00000581319 481 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-8■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.52e-10■■■■□ 20
NOL12Q9UGY1 ACADVL-213ENST00000578579 458 ntTSL 35.74□□□□□ -1.491e-16■■■■□ 19.8
NOL12Q9UGY1 RPS3-220ENST00000534555 387 ntTSL 314.14□□□□□ -0.151e-17■■■■□ 19.7
NOL12Q9UGY1 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-17■■■■□ 19.7
NOL12Q9UGY1 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 310.27□□□□□ -0.771e-17■■■■□ 19.7
NOL12Q9UGY1 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 58.06□□□□□ -1.121e-17■■■■□ 19.7
NOL12Q9UGY1 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC6.84□□□□□ -1.311e-17■■■■□ 19.7
NOL12Q9UGY1 VARS2-209ENST00000477288 6054 ntTSL 220.93■□□□□ 0.946e-8■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.616e-8■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.486e-8■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.436e-8■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.336e-8■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 524.73■■□□□ 1.551e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.991e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)19.19■□□□□ 0.661e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SUPT7L-204ENST00000406540 2869 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 29.76□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.021e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.031e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 ATP2A2-208ENST00000549840 503 ntTSL 58.17□□□□□ -1.11e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 ATP2A2-205ENST00000547050 1176 ntTSL 46.04□□□□□ -1.441e-7■■■■□ 19.5
NOL12Q9UGY1 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)24.27■■□□□ 1.489e-7■■■■□ 19.3
Retrieved 100 of 4,605 protein–RNA pairs in 153.6 ms