RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.61■■■□□ 2.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.24■■□□□ 1.95
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.67■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APLP2Q06481 763 aa26.64■■□□□ 1.86
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.36■■□□□ 1.81
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYT1Q01538 1121 aa26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM41Q8WV44 630 aa25.82■■□□□ 1.72
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEFLP07196 543 aa25.76■■□□□ 1.71
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCC9O60706 1549 aa25.65■■□□□ 1.7
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HRCP23327 699 aa25.41■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 27.6
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITGAEP38570 1179 aa24.89■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.84■■□□□ 1.57
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.75■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.49■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.46■■□□□ 1.51
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCRIBQ14160 1630 aa24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.42■■□□□ 1.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.38■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCANQ96GW7 911 aa24.37■■□□□ 1.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEUROD1Q13562 356 aa24.15■■□□□ 1.46
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBLN2P98095 1184 aa24.12■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANP32CO43423 234 aa24.08■■□□□ 1.45
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM52Q96A61 297 aa24.05■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.03■■□□□ 1.44
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NACADO15069 1562 aa23.79■■□□□ 1.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.76■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P3H3Q8IVL6 736 aa23.74■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARID3CA6NKF2 412 aa23.66■■□□□ 1.38
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FKBP8Q14318 412 aa23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCL11AQ9H165 835 aa23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC24A1O60721 1099 aa23.39■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEFMP07197 916 aa23.36■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.34■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NBR1Q14596 966 aa23.31■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.28■■□□□ 1.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TONSLQ96HA7 1378 aa23.25■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa23.23■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.2■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.18■■□□□ 1.3
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIER1Q8N108 512 aa23.1■■□□□ 1.29
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARXQ96QS3 562 aa23.08■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERCC6Q03468 1493 aa23.05■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMC1Q8TDI8 760 aa23.02■■□□□ 1.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRS2Q9HD23 443 aa22.97■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLIP1P30622 1438 aa22.9■■□□□ 1.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF27Q86VH2 1401 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.88■■□□□ 1.25
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