Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC148Q8NFR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC148Q8NFR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC148Q8NFR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC148Q8NFR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC148Q8NFR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC148Q8NFR7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC148Q8NFR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms