Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.96□□□□□ -0.331e-20■■■■■ 46
DHX30Q7L2E3 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.125e-15■■■■■ 45.9
DHX30Q7L2E3 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 45.8
DHX30Q7L2E3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 45.8
DHX30Q7L2E3 CBFA2T3-203ENST00000562719 539 ntTSL 512.24□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 45.6
DHX30Q7L2E3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.795e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 230.97■■■□□ 2.555e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 430.53■■■□□ 2.485e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EMID1-207ENST00000435427 482 ntTSL 530.53■■■□□ 2.485e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.475e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 530.47■■■□□ 2.475e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.465e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.385e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.375e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 229.63■■■□□ 2.335e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.315e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 229.37■■■□□ 2.295e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 529.06■■■□□ 2.245e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.25e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-214ENST00000573636 913 ntTSL 528.4■■■□□ 2.145e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.095e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.095e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.085e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 228.03■■■□□ 2.085e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EMID1-204ENST00000429226 769 ntTSL 527.86■■■□□ 2.055e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.045e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.985e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.955e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.935e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.95e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-218ENST00000576343 1006 ntTSL 526.5■■□□□ 1.835e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.825e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.745e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DEGS2-203ENST00000557117 840 ntTSL 225.83■■□□□ 1.735e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC069368.1-201ENST00000502574 1178 ntTSL 225.71■■□□□ 1.715e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.685e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC026412.1-205ENST00000522848 1130 ntTSL 225.48■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.665e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 325.08■■□□□ 1.615e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EMID1-205ENST00000430127 641 ntTSL 525.04■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-223ENST00000494397 1752 ntTSL 524.7■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 524.69■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 524.64■■□□□ 1.545e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARF1-206ENST00000473949 578 ntTSL 524.56■■□□□ 1.525e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.525e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-210ENST00000572473 575 ntTSL 524.51■■□□□ 1.515e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.55e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.495e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.485e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FGFRL1-206ENST00000512174 571 ntTSL 324.17■■□□□ 1.465e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CCS-207ENST00000531990 868 ntTSL 224.16■■□□□ 1.465e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.465e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 SLC19A1-210ENST00000486303 708 ntTSL 224.08■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.435e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.425e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.425e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-227ENST00000576470 593 ntTSL 223.9■■□□□ 1.425e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.325e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.35e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.275e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.275e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.265e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 GATA2-205ENST00000492608 844 ntTSL 322.88■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 322.86■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-224ENST00000575989 565 ntTSL 422.83■■□□□ 1.255e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 322.74■■□□□ 1.235e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 322.6■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.44■■□□□ 1.181e-8■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FGFRL1-204ENST00000507339 562 ntTSL 422.4■■□□□ 1.185e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 522.35■■□□□ 1.175e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 ARHGAP4-217ENST00000466928 840 ntTSL 222.26■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FBXO22-206ENST00000565131 471 ntTSL 322.24■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 322.22■■□□□ 1.155e-11■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 GATA2-206ENST00000498200 563 ntTSL 222.1■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.84■■□□□ 1.095e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 221.77■■□□□ 1.085e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 321.72■■□□□ 1.075e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FBXO22-208ENST00000569054 782 ntTSL 521.66■■□□□ 1.065e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRABD-205ENST00000463233 2404 ntTSL 1 (best)21.64■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.055e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 SIN3A-212ENST00000568919 455 ntTSL 221.37■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGAP3-225ENST00000498559 581 ntTSL 221.36■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-217ENST00000556980 801 ntTSL 521.08■□□□□ 0.975e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.965e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 AGAP3-207ENST00000467724 826 ntTSL 520.98■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.955e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.945e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 220.84■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 FBXO22-205ENST00000565036 725 ntTSL 520.69■□□□□ 0.95e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.875e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 XRCC3-215ENST00000555964 562 ntTSL 420.22■□□□□ 0.835e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 520.09■□□□□ 0.815e-6■■■■■ 45.5
DHX30Q7L2E3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 45.5
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 28.5 ms