Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CEACAM3P40198 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM3P40198 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM3P40198 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CEACAM3P40198 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM3P40198 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM3P40198 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM3P40198 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM3P40198 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CEACAM3P40198 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM3P40198 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM3P40198 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM3P40198 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM3P40198 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CEACAM3P40198 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM3P40198 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CEACAM3P40198 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM3P40198 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM3P40198 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM3P40198 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM3P40198 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CEACAM3P40198 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEACAM3P40198 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEACAM3P40198 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CEACAM3P40198 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CEACAM3P40198 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms