Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYH11P35749 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYH11P35749 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MYH11P35749 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MYH11P35749 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MYH11P35749 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYH11P35749 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYH11P35749 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYH11P35749 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYH11P35749 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYH11P35749 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYH11P35749 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYH11P35749 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYH11P35749 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYH11P35749 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYH11P35749 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYH11P35749 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYH11P35749 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYH11P35749 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYH11P35749 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYH11P35749 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYH11P35749 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYH11P35749 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYH11P35749 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYH11P35749 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYH11P35749 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYH11P35749 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MYH11P35749 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYH11P35749 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYH11P35749 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYH11P35749 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYH11P35749 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYH11P35749 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYH11P35749 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYH11P35749 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYH11P35749 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYH11P35749 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYH11P35749 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYH11P35749 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYH11P35749 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH11P35749 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH11P35749 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH11P35749 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH11P35749 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MYH11P35749 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYH11P35749 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MYH11P35749 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYH11P35749 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYH11P35749 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYH11P35749 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MYH11P35749 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYH11P35749 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH11P35749 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH11P35749 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH11P35749 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH11P35749 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MYH11P35749 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYH11P35749 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH11P35749 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH11P35749 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH11P35749 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH11P35749 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MYH11P35749 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYH11P35749 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MYH11P35749 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
MYH11P35749 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH11P35749 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH11P35749 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYH11P35749 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYH11P35749 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH11P35749 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH11P35749 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYH11P35749 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYH11P35749 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH11P35749 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH11P35749 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH11P35749 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYH11P35749 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYH11P35749 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH11P35749 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH11P35749 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH11P35749 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH11P35749 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYH11P35749 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MYH11P35749 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYH11P35749 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYH11P35749 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYH11P35749 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYH11P35749 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYH11P35749 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYH11P35749 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYH11P35749 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 319.1 ms