Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADLP28330 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADLP28330 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACADLP28330 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACADLP28330 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACADLP28330 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADLP28330 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADLP28330 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACADLP28330 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADLP28330 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADLP28330 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ACADLP28330 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADLP28330 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADLP28330 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACADLP28330 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACADLP28330 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADLP28330 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADLP28330 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADLP28330 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADLP28330 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACADLP28330 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADLP28330 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADLP28330 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADLP28330 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADLP28330 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACADLP28330 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADLP28330 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADLP28330 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACADLP28330 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACADLP28330 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADLP28330 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADLP28330 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADLP28330 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADLP28330 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACADLP28330 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADLP28330 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADLP28330 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACADLP28330 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACADLP28330 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACADLP28330 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACADLP28330 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACADLP28330 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACADLP28330 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACADLP28330 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACADLP28330 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACADLP28330 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADLP28330 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADLP28330 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACADLP28330 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADLP28330 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADLP28330 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADLP28330 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACADLP28330 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADLP28330 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADLP28330 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACADLP28330 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADLP28330 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADLP28330 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACADLP28330 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADLP28330 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACADLP28330 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADLP28330 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADLP28330 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACADLP28330 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADLP28330 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACADLP28330 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADLP28330 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADLP28330 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACADLP28330 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADLP28330 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADLP28330 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACADLP28330 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACADLP28330 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADLP28330 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACADLP28330 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACADLP28330 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACADLP28330 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADLP28330 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACADLP28330 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADLP28330 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADLP28330 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADLP28330 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADLP28330 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACADLP28330 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADLP28330 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACADLP28330 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACADLP28330 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADLP28330 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADLP28330 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACADLP28330 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADLP28330 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADLP28330 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADLP28330 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADLP28330 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACADLP28330 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADLP28330 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADLP28330 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ACADLP28330 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADLP28330 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACADLP28330 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms