Protein–RNA interactions for Protein: P28330

ACADL, Long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADLP28330 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ACADLP28330 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ACADLP28330 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ACADLP28330 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ACADLP28330 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ACADLP28330 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ACADLP28330 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ACADLP28330 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ACADLP28330 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ACADLP28330 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ACADLP28330 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ACADLP28330 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACADLP28330 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
ACADLP28330 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ACADLP28330 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ACADLP28330 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ACADLP28330 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ACADLP28330 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ACADLP28330 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ACADLP28330 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ACADLP28330 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ACADLP28330 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACADLP28330 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACADLP28330 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACADLP28330 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ACADLP28330 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ACADLP28330 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACADLP28330 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACADLP28330 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACADLP28330 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ACADLP28330 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ACADLP28330 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ACADLP28330 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACADLP28330 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACADLP28330 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ACADLP28330 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ACADLP28330 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACADLP28330 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ACADLP28330 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ACADLP28330 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ACADLP28330 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACADLP28330 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACADLP28330 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ACADLP28330 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ACADLP28330 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ACADLP28330 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ACADLP28330 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ACADLP28330 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ACADLP28330 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ACADLP28330 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ACADLP28330 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ACADLP28330 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ACADLP28330 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACADLP28330 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ACADLP28330 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ACADLP28330 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACADLP28330 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACADLP28330 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACADLP28330 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ACADLP28330 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACADLP28330 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACADLP28330 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACADLP28330 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ACADLP28330 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACADLP28330 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ACADLP28330 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ACADLP28330 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ACADLP28330 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ACADLP28330 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ACADLP28330 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACADLP28330 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACADLP28330 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACADLP28330 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ACADLP28330 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACADLP28330 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ACADLP28330 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ACADLP28330 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACADLP28330 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ACADLP28330 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACADLP28330 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACADLP28330 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACADLP28330 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADLP28330 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADLP28330 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADLP28330 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADLP28330 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ACADLP28330 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACADLP28330 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADLP28330 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADLP28330 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACADLP28330 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACADLP28330 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACADLP28330 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACADLP28330 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACADLP28330 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACADLP28330 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ACADLP28330 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ACADLP28330 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACADLP28330 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACADLP28330 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms