Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 NDUFA5-209ENST00000491033 662 ntTSL 212.72□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-213ENST00000477274 705 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-202ENST00000369974 3319 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AP1B1-203ENST00000402502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AP1B1-205ENST00000415447 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-201ENST00000328664 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AP1B1-204ENST00000405198 3838 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-205ENST00000423253 951 ntTSL 510.21□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 SCAMP3-206ENST00000478737 649 ntTSL 39.72□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 SCAMP3-205ENST00000472397 1030 ntTSL 39.51□□□□□ -0.891e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TRAPPC1-202ENST00000540486 759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TRAPPC1-203ENST00000571739 648 ntTSL 38.5□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 NDUFA5-208ENST00000490618 2802 ntTSL 28.49□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 NDUFA5-210ENST00000492549 571 ntTSL 25.05□□□□□ -1.61e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TSPAN4-212ENST00000494815 2187 ntTSL 218.34■□□□□ 0.538e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 226.05■■□□□ 1.764e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HSPBP1-204ENST00000585927 666 ntTSL 525.24■■□□□ 1.631e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HSPBP1-209ENST00000593263 884 ntTSL 224.1■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HSPBP1-207ENST00000587959 424 ntTSL 523.24■■□□□ 1.311e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.251e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-203ENST00000577379 861 ntTSL 522.1■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.11e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-209ENST00000619192 416 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-210ENST00000620412 590 ntTSL 220.94■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-202ENST00000371720 713 ntTSL 420.94■□□□□ 0.944e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 MSMO1-205ENST00000507013 973 ntTSL 220.78■□□□□ 0.921e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-212ENST00000622209 1013 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.884e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-207ENST00000612553 1174 ntTSL 219.93■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-208ENST00000614402 505 ntTSL 219.53■□□□□ 0.727e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-211ENST00000585091 739 ntTSL 318.82■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-205ENST00000580090 752 ntTSL 218.16■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-207ENST00000583767 894 ntTSL 317.67■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-204ENST00000579520 702 ntTSL 316.65■□□□□ 0.261e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-210ENST00000584600 730 ntTSL 215.71■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-208ENST00000546132 573 ntTSL 415.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 TSN-203ENST00000455432 555 ntTSL 414.88□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 TSN-209ENST00000490717 560 ntTSL 414.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 TSN-205ENST00000478165 578 ntTSL 314.74□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-205ENST00000536130 604 ntTSL 314.02□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 CD68-204ENST00000584502 582 ntTSL 212.97□□□□□ -0.331e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-203ENST00000425637 1632 ntTSL 212.7□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-208ENST00000565070 1853 ntTSL 512.48□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-207ENST00000543139 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.34□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-214ENST00000569236 1782 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RMI2-202ENST00000572173 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-204ENST00000563273 626 ntTSL 311.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 BLMH-204ENST00000577623 823 ntTSL 511.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-202ENST00000561960 609 ntTSL 310.96□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-213ENST00000567710 472 ntTSL 310.51□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 COX6C-211ENST00000606245 646 nt10.41□□□□□ -0.744e-14■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-211ENST00000566087 878 ntTSL 510.39□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 BLMH-210ENST00000581037 788 ntTSL 59.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 C12orf65-206ENST00000538888 727 ntTSL 39.77□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-206ENST00000563900 493 ntTSL 38.64□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-207ENST00000564342 625 ntTSL 37.99□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 TSN-210ENST00000495112 605 ntTSL 47.94□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-210ENST00000531954 581 ntTSL 47.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 NSMCE1-205ENST00000563512 552 ntTSL 47.78□□□□□ -1.161e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 PMPCA-206ENST00000610649 756 ntTSL 57.1□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 50.6
RPS3P23396 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.7□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 GART-215ENST00000482663 616 ntTSL 36.02□□□□□ -1.451e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 BLMH-203ENST00000577306 761 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.631e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 MSMO1-204ENST00000505270 482 ntTSL 34.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 ACTL6A-204ENST00000461125 457 ntTSL 24.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 MARS-209ENST00000547665 670 ntTSL 24.23□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 ACTL6A-209ENST00000484312 316 ntTSL 34.11□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.831e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.881e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.911e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 RGS5-204ENST00000469495 364 ntTSL 51.8□□□□□ -2.121e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 DDX1-206ENST00000478695 554 ntTSL 40.51□□□□□ -2.331e-7■■■■■ 50.6
RPS3P23396 UQCRC1-202ENST00000412343 778 ntTSL 320.81■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 50.4
RPS3P23396 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 50.3
RPS3P23396 SDHC-206ENST00000470743 832 ntTSL 58.55□□□□□ -1.042e-11■■■■■ 50.3
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