RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585091.1

CENPX-211, Transcript of centromere protein X, humanhuman

TSL 3

Gene CENPX, Length 739 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPX-211ENST00000585091 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50■■■■■ 5.59
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CENPX-211ENST00000585091 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.89■■■■■ 4.78
CENPX-211ENST00000585091 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.82■■■■■ 4.61
CENPX-211ENST00000585091 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.79■■■■■ 4.44
CENPX-211ENST00000585091 NACADO15069 1562 aa42.44■■■■■ 4.38
CENPX-211ENST00000585091 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.37■■■■■ 4.37
CENPX-211ENST00000585091 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.27■■■■■ 4.362e-6■■□□□ 13.9
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CENPX-211ENST00000585091 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.66■■■■■ 4.26
CENPX-211ENST00000585091 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CENPX-211ENST00000585091 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.17■■■■■ 4.18
CENPX-211ENST00000585091 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.14■■■■■ 4.18
CENPX-211ENST00000585091 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.08■■■■■ 4.17
CENPX-211ENST00000585091 SCRIBQ14160 1630 aa41.07■■■■■ 4.16
CENPX-211ENST00000585091 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.04■■■■■ 4.16
CENPX-211ENST00000585091 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.86■■■■■ 4.13
CENPX-211ENST00000585091 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CENPX-211ENST00000585091 CUX2O14529 1486 aa39.69■■■■□ 3.94
CENPX-211ENST00000585091 ERCC6Q03468 1493 aa39.4■■■■□ 3.9
CENPX-211ENST00000585091 NCAPD3P42695 1498 aa39.17■■■■□ 3.86
CENPX-211ENST00000585091 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.11■■■■□ 3.85
CENPX-211ENST00000585091 SMARCA4P51532 1647 aa39.07■■■■□ 3.85
CENPX-211ENST00000585091 SMARCA2P51531 1590 aa38.94■■■■□ 3.82
CENPX-211ENST00000585091 HMGXB3Q12766 1538 aa38.89■■■■□ 3.82
CENPX-211ENST00000585091 TRIM41Q8WV44 630 aa38.81■■■■□ 3.8
CENPX-211ENST00000585091 NESP48681 1621 aa38.8■■■■□ 3.8
CENPX-211ENST00000585091 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CENPX-211ENST00000585091 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
CENPX-211ENST00000585091 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.61■■■■□ 3.77
CENPX-211ENST00000585091 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.6■■■■□ 3.77
CENPX-211ENST00000585091 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.77
CENPX-211ENST00000585091 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.34■■■■□ 3.73
CENPX-211ENST00000585091 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.3■■■■□ 3.72
CENPX-211ENST00000585091 WIZO95785 1651 aa38.18■■■■□ 3.7
CENPX-211ENST00000585091 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.14■■■■□ 3.7
CENPX-211ENST00000585091 CADPSQ9ULU8 1353 aa38■■■■□ 3.67
CENPX-211ENST00000585091 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.86■■■■□ 3.65
CENPX-211ENST00000585091 WDR62O43379 1518 aa37.79■■■■□ 3.64
CENPX-211ENST00000585091 OSCARQ8IYS5 282 aa37.76■■■■□ 3.64
CENPX-211ENST00000585091 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.7■■■■□ 3.63
CENPX-211ENST00000585091 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.67■■■■□ 3.62
CENPX-211ENST00000585091 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.63■■■■□ 3.61
CENPX-211ENST00000585091 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
CENPX-211ENST00000585091 CFTRP13569 1480 aa37.55■■■■□ 3.6
CENPX-211ENST00000585091 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
CENPX-211ENST00000585091 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.33■■■■□ 3.57
CENPX-211ENST00000585091 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.33■■■■□ 3.57
CENPX-211ENST00000585091 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.33■■■■□ 3.57
CENPX-211ENST00000585091 PRDM2Q13029 1718 aa37.24■■■■□ 3.55
CENPX-211ENST00000585091 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.19■■■■□ 3.54
CENPX-211ENST00000585091 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
CENPX-211ENST00000585091 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.98■■■■□ 3.51
CENPX-211ENST00000585091 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
CENPX-211ENST00000585091 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.95■■■■□ 3.51
CENPX-211ENST00000585091 TOPBP1Q92547 1522 aa36.91■■■■□ 3.5
CENPX-211ENST00000585091 IFT140Q96RY7 1462 aa36.88■■■■□ 3.49
CENPX-211ENST00000585091 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.74■■■■□ 3.47
CENPX-211ENST00000585091 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
CENPX-211ENST00000585091 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
CENPX-211ENST00000585091 ABCC8Q09428 1581 aa36.67■■■■□ 3.46
CENPX-211ENST00000585091 ARAP1Q96P48 1450 aa36.66■■■■□ 3.46
CENPX-211ENST00000585091 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
CENPX-211ENST00000585091 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.452e-7■■■■□ 22.9
CENPX-211ENST00000585091 CHD1O14646 1710 aa36.54■■■■□ 3.44
CENPX-211ENST00000585091 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CENPX-211ENST00000585091 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.47■■■■□ 3.43
CENPX-211ENST00000585091 FBLN2P98095 1184 aa36.43■■■■□ 3.42
CENPX-211ENST00000585091 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CENPX-211ENST00000585091 SOGA1O94964 1423 aa36.33■■■■□ 3.41
CENPX-211ENST00000585091 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.31■■■■□ 3.4
CENPX-211ENST00000585091 CUX1P39880 1505 aa36.28■■■■□ 3.4
CENPX-211ENST00000585091 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.21■■■■□ 3.39
CENPX-211ENST00000585091 WDR97A6NE52 1622 aa36.07■■■■□ 3.36
CENPX-211ENST00000585091 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.06■■■■□ 3.36
CENPX-211ENST00000585091 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
CENPX-211ENST00000585091 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.01■■■■□ 3.36
CENPX-211ENST00000585091 GRIN2BQ13224 1484 aa36■■■■□ 3.35
CENPX-211ENST00000585091 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CENPX-211ENST00000585091 PBRM1Q86U86 1689 aa35.97■■■■□ 3.35
CENPX-211ENST00000585091 SYNJ1O43426 1573 aa35.95■■■■□ 3.35
CENPX-211ENST00000585091 SYNJ2O15056 1496 aa35.91■■■■□ 3.34
CENPX-211ENST00000585091 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.89■■■■□ 3.34
CENPX-211ENST00000585091 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.83■■■■□ 3.33
CENPX-211ENST00000585091 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.82■■■■□ 3.32
CENPX-211ENST00000585091 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.62■■■■□ 3.29
CENPX-211ENST00000585091 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.62■■■■□ 3.29
CENPX-211ENST00000585091 TOP2BQ02880 1626 aa35.6■■■■□ 3.29
CENPX-211ENST00000585091 ADAMTS12P58397 1594 aa35.59■■■■□ 3.29
CENPX-211ENST00000585091 GRIN2AQ12879 1464 aa35.58■■■■□ 3.29
CENPX-211ENST00000585091 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.58■■■■□ 3.29
CENPX-211ENST00000585091 CEP170Q5SW79 1584 aa35.53■■■■□ 3.28
CENPX-211ENST00000585091 NUP160Q12769 1436 aa35.44■■■■□ 3.26
CENPX-211ENST00000585091 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.4■■■■□ 3.26
CENPX-211ENST00000585091 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.34■■■■□ 3.25
CENPX-211ENST00000585091 SHROOM2Q13796 1616 aa35.32■■■■□ 3.25
CENPX-211ENST00000585091 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.29■■■■□ 3.24
CENPX-211ENST00000585091 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CENPX-211ENST00000585091 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
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