RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593263.5

HSPBP1-209, Transcript of HSPA (Hsp70) binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene HSPBP1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPBP1-209ENST00000593263 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.39■■■■■ 7.26
HSPBP1-209ENST00000593263 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.75■■■■■ 6.19
HSPBP1-209ENST00000593263 ABCC9O60706 1549 aa52.81■■■■■ 6.05
HSPBP1-209ENST00000593263 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.66■■■■■ 5.7
HSPBP1-209ENST00000593263 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.59■■■■■ 5.69
HSPBP1-209ENST00000593263 NACADO15069 1562 aa50.52■■■■■ 5.68
HSPBP1-209ENST00000593263 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.31■■■■■ 5.64
HSPBP1-209ENST00000593263 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.11■■■■■ 5.61
HSPBP1-209ENST00000593263 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.87■■■■■ 5.57
HSPBP1-209ENST00000593263 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.55■■■■■ 5.52
HSPBP1-209ENST00000593263 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.31■■■■■ 5.48
HSPBP1-209ENST00000593263 SCRIBQ14160 1630 aa49.16■■■■■ 5.46
HSPBP1-209ENST00000593263 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.15■■■■■ 5.46
HSPBP1-209ENST00000593263 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.52■■■■■ 5.36
HSPBP1-209ENST00000593263 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.5■■■■■ 5.35
HSPBP1-209ENST00000593263 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
HSPBP1-209ENST00000593263 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.72■■■■■ 5.23
HSPBP1-209ENST00000593263 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.42■■■■■ 5.18
HSPBP1-209ENST00000593263 SMARCA4P51532 1647 aa46.93■■■■■ 5.1
HSPBP1-209ENST00000593263 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
HSPBP1-209ENST00000593263 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.66■■■■■ 5.06
HSPBP1-209ENST00000593263 NCAPD3P42695 1498 aa46.6■■■■■ 5.05
HSPBP1-209ENST00000593263 SMARCA2P51531 1590 aa46.6■■■■■ 5.05
HSPBP1-209ENST00000593263 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.59■■■■■ 5.05
HSPBP1-209ENST00000593263 HMGXB3Q12766 1538 aa46.41■■■■■ 5.02
HSPBP1-209ENST00000593263 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.39■■■■■ 5.02
HSPBP1-209ENST00000593263 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
HSPBP1-209ENST00000593263 WIZO95785 1651 aa46.11■■■■■ 4.97
HSPBP1-209ENST00000593263 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.97■■■■■ 4.95
HSPBP1-209ENST00000593263 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
HSPBP1-209ENST00000593263 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
HSPBP1-209ENST00000593263 ERCC6Q03468 1493 aa45.53■■■■■ 4.88
HSPBP1-209ENST00000593263 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.43■■■■■ 4.86
HSPBP1-209ENST00000593263 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.26■■■■■ 4.84
HSPBP1-209ENST00000593263 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.12■■■■■ 4.81
HSPBP1-209ENST00000593263 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.11■■■■■ 4.81
HSPBP1-209ENST00000593263 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.02■■■■■ 4.8
HSPBP1-209ENST00000593263 CUX2O14529 1486 aa44.98■■■■■ 4.79
HSPBP1-209ENST00000593263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
HSPBP1-209ENST00000593263 CFTRP13569 1480 aa44.98■■■■■ 4.79
HSPBP1-209ENST00000593263 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.81■■■■■ 4.76
HSPBP1-209ENST00000593263 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
HSPBP1-209ENST00000593263 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.78■■■■■ 4.76
HSPBP1-209ENST00000593263 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.72■■■■■ 4.75
HSPBP1-209ENST00000593263 PRDM2Q13029 1718 aa44.67■■■■■ 4.74
HSPBP1-209ENST00000593263 WDR62O43379 1518 aa44.57■■■■■ 4.73
HSPBP1-209ENST00000593263 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
HSPBP1-209ENST00000593263 TOPBP1Q92547 1522 aa44.08■■■■■ 4.65
HSPBP1-209ENST00000593263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.02■■■■■ 4.64
HSPBP1-209ENST00000593263 ABCC8Q09428 1581 aa43.97■■■■■ 4.63
HSPBP1-209ENST00000593263 IFT140Q96RY7 1462 aa43.8■■■■■ 4.6
HSPBP1-209ENST00000593263 CUX1P39880 1505 aa43.73■■■■■ 4.59
HSPBP1-209ENST00000593263 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.71■■■■■ 4.59
HSPBP1-209ENST00000593263 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
HSPBP1-209ENST00000593263 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
HSPBP1-209ENST00000593263 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.6■■■■■ 4.57
HSPBP1-209ENST00000593263 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
HSPBP1-209ENST00000593263 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.55■■■■■ 4.56
HSPBP1-209ENST00000593263 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.53■■■■■ 4.56
HSPBP1-209ENST00000593263 SOGA1O94964 1423 aa43.48■■■■■ 4.55
HSPBP1-209ENST00000593263 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.54
HSPBP1-209ENST00000593263 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.37■■■■■ 4.53
HSPBP1-209ENST00000593263 SYNJ1O43426 1573 aa43.33■■■■■ 4.53
HSPBP1-209ENST00000593263 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
HSPBP1-209ENST00000593263 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.29■■■■■ 4.52
HSPBP1-209ENST00000593263 TOP2BQ02880 1626 aa43.28■■■■■ 4.52
HSPBP1-209ENST00000593263 WDR97A6NE52 1622 aa43.24■■■■■ 4.51
HSPBP1-209ENST00000593263 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.11■■■■■ 4.49
HSPBP1-209ENST00000593263 OSCARQ8IYS5 282 aa43.07■■■■■ 4.49
HSPBP1-209ENST00000593263 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.03■■■■■ 4.48
HSPBP1-209ENST00000593263 CHD1O14646 1710 aa43■■■■■ 4.47
HSPBP1-209ENST00000593263 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43■■■■■ 4.47
HSPBP1-209ENST00000593263 GRIN2BQ13224 1484 aa43■■■■■ 4.47
HSPBP1-209ENST00000593263 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
HSPBP1-209ENST00000593263 PBRM1Q86U86 1689 aa42.98■■■■■ 4.47
HSPBP1-209ENST00000593263 FBLN2P98095 1184 aa42.94■■■■■ 4.46
HSPBP1-209ENST00000593263 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
HSPBP1-209ENST00000593263 SYNJ2O15056 1496 aa42.74■■■■■ 4.43
HSPBP1-209ENST00000593263 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
HSPBP1-209ENST00000593263 ADAMTS12P58397 1594 aa42.63■■■■■ 4.41
HSPBP1-209ENST00000593263 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.58■■■■■ 4.41
HSPBP1-209ENST00000593263 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HSPBP1-209ENST00000593263 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HSPBP1-209ENST00000593263 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.51■■■■■ 4.4
HSPBP1-209ENST00000593263 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.48■■■■■ 4.39
HSPBP1-209ENST00000593263 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.47■■■■■ 4.39
HSPBP1-209ENST00000593263 ARHGEF11O15085 1522 aa42.47■■■■■ 4.39
HSPBP1-209ENST00000593263 GRIN2AQ12879 1464 aa42.47■■■■■ 4.39
HSPBP1-209ENST00000593263 KIF27Q86VH2 1401 aa42.46■■■■■ 4.39
HSPBP1-209ENST00000593263 TRIM41Q8WV44 630 aa42.4■■■■■ 4.38
HSPBP1-209ENST00000593263 CEP170Q5SW79 1584 aa42.3■■■■■ 4.36
HSPBP1-209ENST00000593263 IGF1RP08069 1367 aa42.26■■■■■ 4.35
HSPBP1-209ENST00000593263 NUP160Q12769 1436 aa42.25■■■■■ 4.35
HSPBP1-209ENST00000593263 CUL7Q14999 1698 aa42.21■■■■■ 4.35
HSPBP1-209ENST00000593263 ARAP1Q96P48 1450 aa42.13■■■■■ 4.34
HSPBP1-209ENST00000593263 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.1■■■■■ 4.33
HSPBP1-209ENST00000593263 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.06■■■■■ 4.32
HSPBP1-209ENST00000593263 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.03■■■■■ 4.32
HSPBP1-209ENST00000593263 SHROOM2Q13796 1616 aa41.96■■■■■ 4.31
HSPBP1-209ENST00000593263 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.6 ms