Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 BUD23-203ENST00000421744 895 ntTSL 220.8■□□□□ 0.923e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-208ENST00000432522 1074 ntTSL 220.65■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)20.57■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-216ENST00000478670 572 ntTSL 420.36■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-218ENST00000496153 505 ntTSL 420.36■□□□□ 0.853e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-214ENST00000464615 458 ntTSL 520.19■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 519.93■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 NANS-206ENST00000495319 764 ntTSL 319.79■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-210ENST00000529861 857 ntTSL 319.57■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-207ENST00000525895 1527 ntTSL 219.51■□□□□ 0.713e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 519.13■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNFRSF4-202ENST00000453580 393 ntTSL 318.97■□□□□ 0.633e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AGRN-209ENST00000492947 690 ntTSL 218.81■□□□□ 0.62e-13■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM5C-207ENST00000429877 870 ntTSL 318.81■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 218.75■□□□□ 0.593e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 218.24■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-206ENST00000585910 656 ntTSL 218.13■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-207ENST00000547388 576 ntTSL 417.8■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SAMM50-203ENST00000474323 2368 ntTSL 217.77■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 317.64■□□□□ 0.419e-8■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-211ENST00000542238 735 ntTSL 317.64■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CHCHD6-208ENST00000515867 778 ntTSL 517.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CRIP2-206ENST00000548923 582 ntTSL 317.51■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.393e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-213ENST00000463307 1815 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-214ENST00000545432 545 ntTSL 417.11■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-211ENST00000549572 1514 ntTSL 517.09■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-13■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-210ENST00000467982 1855 ntTSL 517.01■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM5C-206ENST00000428012 766 ntTSL 316.45■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-204ENST00000433067 6124 ntTSL 516.43■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PLBD2-204ENST00000548997 465 ntTSL 316.43■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TMEM129-203ENST00000460722 1100 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-212ENST00000480070 832 ntTSL 516.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-201ENST00000369051 2106 ntTSL 516.17■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-210ENST00000549028 557 ntTSL 416.16■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-217ENST00000551741 992 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PPP2R3B-204ENST00000468169 713 ntTSL 315.95■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-213ENST00000489661 856 ntTSL 315.93■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-205ENST00000517306 2294 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-215ENST00000550407 1132 ntTSL 515.83■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-213ENST00000549679 1466 ntTSL 515.78■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-214ENST00000542030 460 ntTSL 415.76■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-216ENST00000496124 435 ntTSL 315.75■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-227ENST00000523576 860 ntTSL 315.62■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PRDM15-206ENST00000447016 4992 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-216ENST00000551157 1008 ntTSL 315.44■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-205ENST00000428163 577 ntTSL 315.33■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-214ENST00000527784 1069 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-13■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -03e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARBP2-218ENST00000552650 954 ntTSL 214.93□□□□□ -0.023e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 PHF21A-211ENST00000529734 557 ntTSL 414.88□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 514.76□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 214.72□□□□□ -0.052e-13■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C11orf49-220ENST00000533124 559 ntTSL 414.71□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-213ENST00000543552 529 ntTSL 414.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 214.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-207ENST00000536011 992 ntTSL 214.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-209ENST00000529612 574 ntTSL 414.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 CTSH-207ENST00000528741 719 ntTSL 514.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 29.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 366.5 ms