Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 416.66■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 216.04■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MCTP2-204ENST00000456504 4493 ntTSL 1 (best)11.3□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.667e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-215ENST00000625837 3237 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.737e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-216ENST00000626301 3013 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.787e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-218ENST00000629785 3457 ntTSL 59.91□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-219ENST00000630255 3289 ntTSL 59.88□□□□□ -0.837e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-221ENST00000630858 3181 ntTSL 59.84□□□□□ -0.837e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-220ENST00000630370 3120 ntTSL 59.56□□□□□ -0.887e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-204ENST00000478993 3397 ntTSL 1 (best)9.54□□□□□ -0.887e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-222ENST00000631641 583 ntTSL 38.17□□□□□ -1.17e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-211ENST00000615742 485 ntTSL 48□□□□□ -1.137e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.137e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.184e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 56.39□□□□□ -1.395e-9■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.659e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.85e-9■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MBNL2-205ENST00000449284 581 ntTSL 23.4□□□□□ -1.879e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.879e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.029e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 59.13□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 56.8
TBRG4Q969Z0 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 57.33□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 56.8
TBRG4Q969Z0 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 56.11□□□□□ -1.434e-7■■■■■ 56.8
TBRG4Q969Z0 FBXW5-202ENST00000428398 718 ntTSL 526.56■■□□□ 1.845e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 FBXW5-206ENST00000483559 2392 ntTSL 226.44■■□□□ 1.825e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 FBXW5-203ENST00000443788 839 ntTSL 225.86■■□□□ 1.735e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 FBXW5-204ENST00000459905 2339 ntTSL 225.03■■□□□ 1.65e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.355e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 FBXW5-208ENST00000491246 785 ntTSL 519.38■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 FBXW5-205ENST00000480818 1442 ntTSL 517.91■□□□□ 0.465e-9■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 STK11-207ENST00000589152 3365 ntTSL 215.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 56.7
TBRG4Q969Z0 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 56.6
TBRG4Q969Z0 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 56.5
TBRG4Q969Z0 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.052e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 218.93■□□□□ 0.622e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 218.06■□□□□ 0.482e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-13■■■■■ 56.3
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TBRG4Q969Z0 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 38.97□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38□□□□□ -1.132e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 43.17□□□□□ -1.92e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.61□□□□□ -2.152e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 51.1□□□□□ -2.232e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.312e-13■■■■■ 56.3
TBRG4Q969Z0 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 524.66■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 56.2
TBRG4Q969Z0 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 524.62■■□□□ 1.532e-8■■■■■ 56.2
TBRG4Q969Z0 RGS12-211ENST00000506998 1625 ntTSL 1 (best)19.26■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 56.2
TBRG4Q969Z0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 56.2
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TBRG4Q969Z0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 56.2
TBRG4Q969Z0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 56.2
TBRG4Q969Z0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-6■■■■■ 56.2
TBRG4Q969Z0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 56.1
TBRG4Q969Z0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 56.1
TBRG4Q969Z0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 56.1
TBRG4Q969Z0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 DDB1-223ENST00000543658 571 ntTSL 411.89□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 DDB1-217ENST00000540166 3906 ntTSL 28.61□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 55.9
TBRG4Q969Z0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.027e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.058e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 511.2□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 CUX1-201ENST00000292535 13747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 55.8
TBRG4Q969Z0 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 220.38■□□□□ 0.854e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-209ENST00000599192 571 ntTSL 419.19■□□□□ 0.664e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.654e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.324e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-205ENST00000594875 531 ntTSL 216.67■□□□□ 0.264e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-203ENST00000593998 1798 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.224e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-206ENST00000595079 1719 ntTSL 216.11■□□□□ 0.174e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-208ENST00000598255 909 ntTSL 216.11■□□□□ 0.174e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-204ENST00000594348 1021 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 ANGPTL4-207ENST00000597137 582 ntTSL 414.14□□□□□ -0.154e-14■■■■■ 55.6
TBRG4Q969Z0 AHCTF1-204ENST00000477526 571 ntTSL 42.82□□□□□ -1.964e-14■■■■■ 55.6
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