Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 416.95■□□□□ 0.33e-8■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 416.58■□□□□ 0.243e-8■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 415.74■□□□□ 0.113e-8■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 313.58□□□□□ -0.243e-8■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 413.05□□□□□ -0.323e-8■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 212.93□□□□□ -0.343e-8■■■□□ 17.3
UTP3Q9NQZ2 SARS-205ENST00000477544 694 ntTSL 211.03□□□□□ -0.642e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 SARS-206ENST00000482384 804 ntTSL 210.99□□□□□ -0.652e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 ARF4-202ENST00000463880 641 ntTSL 322.31■■□□□ 1.166e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 PRPF19-207ENST00000546152 814 ntTSL 521.35■■□□□ 1.016e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.126e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 PRPF19-206ENST00000541371 943 ntTSL 313.97□□□□□ -0.176e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 511.77□□□□□ -0.536e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 DDX39B-216ENST00000462421 618 ntTSL 39.5□□□□□ -0.891e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.176e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 ARF4-204ENST00000486310 1601 ntTSL 37.55□□□□□ -1.26e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.316e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 ARF4-203ENST00000483848 404 ntTSL 54.52□□□□□ -1.696e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 PYCR2-203ENST00000466127 506 ntTSL 213.49□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 PIM1-203ENST00000479509 675 ntTSL 213.6□□□□□ -0.236e-10■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 PIM1-202ENST00000468243 818 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.556e-10■■■□□ 17.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-248ENST00000524179 598 ntTSL 215.96■□□□□ 0.153e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 PRSS21-208ENST00000575199 679 ntTSL 222.85■■□□□ 1.256e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TCF25-208ENST00000563032 274 ntTSL 221.53■■□□□ 1.046e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 321.01■□□□□ 0.956e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 PRSS21-210ENST00000577043 814 ntTSL 519.96■□□□□ 0.796e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.756e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 VCP-202ENST00000417448 722 ntTSL 319.13■□□□□ 0.656e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TRAM1-202ENST00000518678 535 ntTSL 419.02■□□□□ 0.646e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 FAM160B2-207ENST00000477614 587 ntTSL 318.84■□□□□ 0.616e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TRAM1-203ENST00000520700 542 ntTSL 518.59■□□□□ 0.576e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TCF25-203ENST00000561585 981 ntTSL 217.95■□□□□ 0.466e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 516.97■□□□□ 0.316e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM161B-AS1-205ENST00000504769 548 ntTSL 416.96■□□□□ 0.316e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.216e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-205ENST00000577918 859 ntTSL 315.72■□□□□ 0.116e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 SERTAD3-205ENST00000601217 398 ntTSL 315.57■□□□□ 0.086e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 KPNB1-214ENST00000583648 896 ntTSL 415.36■□□□□ 0.056e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC18-204ENST00000488397 1275 ntTSL 214.44□□□□□ -0.16e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.366e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 CD63-205ENST00000548117 499 ntTSL 212.53□□□□□ -0.46e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.46e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.46e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 C1orf43-209ENST00000493814 441 ntTSL 29.68□□□□□ -0.866e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.876e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 38.5□□□□□ -1.056e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-207ENST00000460432 482 ntTSL 38.42□□□□□ -1.066e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 TXNL1-210ENST00000589931 466 ntTSL 37.16□□□□□ -1.264e-6■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 CSPP1-205ENST00000521168 1457 ntTSL 1 (best)6.22□□□□□ -1.416e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 CSPP1-206ENST00000521324 725 ntTSL 36.21□□□□□ -1.426e-7■■■□□ 17.1
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-207ENST00000432873 603 ntTSL 36.67□□□□□ -1.342e-7■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 26.16□□□□□ -1.422e-7■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 SRSF7-212ENST00000487773 637 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-7■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-226ENST00000453141 997 ntTSL 38.06□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 CHPF2-203ENST00000482173 548 ntTSL 420.46■□□□□ 0.876e-6■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-206ENST00000528561 1099 ntTSL 521.11■□□□□ 0.973e-8■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-205ENST00000527529 898 ntTSL 515.54■□□□□ 0.083e-8■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-207ENST00000528889 745 ntTSL 38.21□□□□□ -1.13e-8■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-225ENST00000552370 882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-228ENST00000553022 540 ntTSL 28.71□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 17
UTP3Q9NQZ2 NARF-207ENST00000577410 873 ntTSL 525.49■■□□□ 1.679e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-217ENST00000581743 785 ntTSL 517.89■□□□□ 0.459e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-210ENST00000578082 841 ntTSL 415.1■□□□□ 0.019e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.121e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.821e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.931e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-223ENST00000545215 1340 ntTSL 1 (best)8.4□□□□□ -1.061e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.11e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.121e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 57.72□□□□□ -1.171e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-214ENST00000536528 516 ntTSL 37.37□□□□□ -1.231e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 LDHA-219ENST00000541097 582 ntTSL 37.19□□□□□ -1.261e-9■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK2A2-203ENST00000563307 4978 ntTSL 315.35■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 SNORA5C-201ENST00000364902 137 ntBASIC11.02□□□□□ -0.651e-21■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-221ENST00000583181 505 ntTSL 521.55■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-224ENST00000584411 525 ntTSL 417.5■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-213ENST00000579198 599 ntTSL 517.02■□□□□ 0.322e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 316.69■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-223ENST00000584192 495 ntTSL 315.56■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 NARF-215ENST00000580748 577 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-223ENST00000514332 2444 ntTSL 214.71□□□□□ -0.064e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.074e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.154e-7■■■□□ 16.9
UTP3Q9NQZ2 MPP1-215ENST00000488754 553 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-8■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM214-213ENST00000495312 804 ntTSL 229.25■■■□□ 2.271e-7■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-214ENST00000486311 473 ntTSL 323.7■■□□□ 1.383e-6■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.133e-6■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM214-202ENST00000321326 2700 ntTSL 221.57■■□□□ 1.041e-7■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 NDUFA3-213ENST00000484103 541 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.883e-6■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-7■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-212ENST00000478616 882 ntTSL 520.03■□□□□ 0.83e-6■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.711e-7■■■□□ 16.8
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-213ENST00000485080 1230 ntTSL 518.92■□□□□ 0.623e-6■■■□□ 16.8
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