RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486311.5

SREBF1-214, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene SREBF1, Length 473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1-214ENST00000486311 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.89■■■■■ 6.54
SREBF1-214ENST00000486311 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.97■■■■■ 5.59
SREBF1-214ENST00000486311 ABCC9O60706 1549 aa49.82■■■■■ 5.57
SREBF1-214ENST00000486311 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.51■■■■■ 5.2
SREBF1-214ENST00000486311 NACADO15069 1562 aa47.27■■■■■ 5.16
SREBF1-214ENST00000486311 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.06■■■■■ 5.12
SREBF1-214ENST00000486311 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.74■■■■■ 5.07
SREBF1-214ENST00000486311 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.73■■■■■ 5.07
SREBF1-214ENST00000486311 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.46■■■■■ 5.03
SREBF1-214ENST00000486311 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.01
SREBF1-214ENST00000486311 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.28■■■■■ 5
SREBF1-214ENST00000486311 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.21■■■■■ 4.99
SREBF1-214ENST00000486311 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.12■■■■■ 4.97
SREBF1-214ENST00000486311 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.6■■■■■ 4.89
SREBF1-214ENST00000486311 SCRIBQ14160 1630 aa45.55■■■■■ 4.88
SREBF1-214ENST00000486311 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.98■■■■■ 4.79
SREBF1-214ENST00000486311 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
SREBF1-214ENST00000486311 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.89■■■■■ 4.78
SREBF1-214ENST00000486311 NCAPD3P42695 1498 aa43.68■■■■■ 4.58
SREBF1-214ENST00000486311 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.57■■■■■ 4.56
SREBF1-214ENST00000486311 SMARCA4P51532 1647 aa43.5■■■■■ 4.55
SREBF1-214ENST00000486311 SMARCA2P51531 1590 aa43.41■■■■■ 4.54
SREBF1-214ENST00000486311 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.36■■■■■ 4.53
SREBF1-214ENST00000486311 HMGXB3Q12766 1538 aa43.33■■■■■ 4.53
SREBF1-214ENST00000486311 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.12■■■■■ 4.49
SREBF1-214ENST00000486311 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
SREBF1-214ENST00000486311 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.05■■■■■ 4.48
SREBF1-214ENST00000486311 ERCC6Q03468 1493 aa43■■■■■ 4.47
SREBF1-214ENST00000486311 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.98■■■■■ 4.47
SREBF1-214ENST00000486311 CUX2O14529 1486 aa42.88■■■■■ 4.46
SREBF1-214ENST00000486311 NESP48681 1621 aa42.86■■■■■ 4.45
SREBF1-214ENST00000486311 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.59■■■■■ 4.41
SREBF1-214ENST00000486311 WIZO95785 1651 aa42.47■■■■■ 4.39
SREBF1-214ENST00000486311 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.4■■■■■ 4.38
SREBF1-214ENST00000486311 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.37■■■■■ 4.37
SREBF1-214ENST00000486311 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
SREBF1-214ENST00000486311 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
SREBF1-214ENST00000486311 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.21■■■■■ 4.35
SREBF1-214ENST00000486311 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
SREBF1-214ENST00000486311 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.99■■■■■ 4.31
SREBF1-214ENST00000486311 CFTRP13569 1480 aa41.92■■■■■ 4.3
SREBF1-214ENST00000486311 WDR62O43379 1518 aa41.87■■■■■ 4.29
SREBF1-214ENST00000486311 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.86■■■■■ 4.29
SREBF1-214ENST00000486311 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.85■■■■■ 4.29
SREBF1-214ENST00000486311 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.57■■■■■ 4.25
SREBF1-214ENST00000486311 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
SREBF1-214ENST00000486311 PRDM2Q13029 1718 aa41.31■■■■■ 4.2
SREBF1-214ENST00000486311 TOPBP1Q92547 1522 aa41.07■■■■■ 4.16
SREBF1-214ENST00000486311 IFT140Q96RY7 1462 aa41.04■■■■■ 4.16
SREBF1-214ENST00000486311 TRIM41Q8WV44 630 aa41.02■■■■■ 4.16
SREBF1-214ENST00000486311 ABCC8Q09428 1581 aa41.02■■■■■ 4.16
SREBF1-214ENST00000486311 OSCARQ8IYS5 282 aa40.98■■■■■ 4.15
SREBF1-214ENST00000486311 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SREBF1-214ENST00000486311 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.92■■■■■ 4.14
SREBF1-214ENST00000486311 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
SREBF1-214ENST00000486311 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SREBF1-214ENST00000486311 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
SREBF1-214ENST00000486311 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.096e-8■■■□□ 17.9
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SREBF1-214ENST00000486311 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.51■■■■■ 4.08
SREBF1-214ENST00000486311 SOGA1O94964 1423 aa40.5■■■■■ 4.07
SREBF1-214ENST00000486311 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.44■■■■■ 4.06
SREBF1-214ENST00000486311 CUX1P39880 1505 aa40.43■■■■■ 4.06
SREBF1-214ENST00000486311 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
SREBF1-214ENST00000486311 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
SREBF1-214ENST00000486311 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
SREBF1-214ENST00000486311 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
SREBF1-214ENST00000486311 WDR97A6NE52 1622 aa40.29■■■■■ 4.04
SREBF1-214ENST00000486311 ARHGEF11O15085 1522 aa40.28■■■■■ 4.04
SREBF1-214ENST00000486311 FBLN2P98095 1184 aa40.28■■■■■ 4.04
SREBF1-214ENST00000486311 CHD1O14646 1710 aa40.24■■■■■ 4.03
SREBF1-214ENST00000486311 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.19■■■■■ 4.02
SREBF1-214ENST00000486311 GRIN2BQ13224 1484 aa40.13■■■■■ 4.02
SREBF1-214ENST00000486311 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SREBF1-214ENST00000486311 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
SREBF1-214ENST00000486311 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.02■■■■■ 4
SREBF1-214ENST00000486311 GAPVD1Q14C86 1478 aa40■■■■□ 3.99
SREBF1-214ENST00000486311 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.99■■■■□ 3.99
SREBF1-214ENST00000486311 SYNJ2O15056 1496 aa39.97■■■■□ 3.99
SREBF1-214ENST00000486311 ARAP1Q96P48 1450 aa39.91■■■■□ 3.98
SREBF1-214ENST00000486311 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.91■■■■□ 3.98
SREBF1-214ENST00000486311 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.91■■■■□ 3.98
SREBF1-214ENST00000486311 SYNJ1O43426 1573 aa39.89■■■■□ 3.98
SREBF1-214ENST00000486311 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.88■■■■□ 3.97
SREBF1-214ENST00000486311 PBRM1Q86U86 1689 aa39.84■■■■□ 3.97
SREBF1-214ENST00000486311 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
SREBF1-214ENST00000486311 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.8■■■■□ 3.96
SREBF1-214ENST00000486311 GRIN2AQ12879 1464 aa39.6■■■■□ 3.93
SREBF1-214ENST00000486311 ADAMTS12P58397 1594 aa39.57■■■■□ 3.92
SREBF1-214ENST00000486311 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.54■■■■□ 3.92
SREBF1-214ENST00000486311 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.53■■■■□ 3.92
SREBF1-214ENST00000486311 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
SREBF1-214ENST00000486311 NUP160Q12769 1436 aa39.49■■■■□ 3.91
SREBF1-214ENST00000486311 CEP170Q5SW79 1584 aa39.41■■■■□ 3.9
SREBF1-214ENST00000486311 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.28■■■■□ 3.88
SREBF1-214ENST00000486311 SHROOM2Q13796 1616 aa39.22■■■■□ 3.87
SREBF1-214ENST00000486311 KIF27Q86VH2 1401 aa39.12■■■■□ 3.85
SREBF1-214ENST00000486311 IGF1RP08069 1367 aa39.1■■■■□ 3.85
SREBF1-214ENST00000486311 JPH4Q96JJ6 628 aa39.09■■■■□ 3.85
SREBF1-214ENST00000486311 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
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