Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 52.83□□□□□ -1.962e-9■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.084e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.34e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.533e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.983e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 PAH-213ENST00000551988 584 ntTSL 36.91□□□□□ -1.31e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.311e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)5.84□□□□□ -1.471e-6■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 BRD8-225ENST00000515014 726 ntTSL 53.64□□□□□ -1.831e-7■■□□□ 12.3
TRA2AQ13595 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.182e-59■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TTC3-216ENST00000479930 8998 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.141e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TTC3-215ENST00000476784 7425 ntTSL 26.08□□□□□ -1.441e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.491e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.441e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 HP1BP3-210ENST00000438032 1159 ntTSL 520.32■□□□□ 0.843e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-207ENST00000555745 582 ntTSL 318.39■□□□□ 0.536e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 INCENP-204ENST00000528375 808 ntTSL 317.29■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-205ENST00000471212 1363 ntTSL 217.02■□□□□ 0.321e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-213ENST00000557905 571 ntTSL 417■□□□□ 0.316e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-212ENST00000557763 933 ntTSL 515.79■□□□□ 0.126e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-206ENST00000486018 699 ntTSL 215.11■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-203ENST00000417173 1215 ntTSL 215.07■□□□□ 06e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-205ENST00000553494 717 ntTSL 314.52□□□□□ -0.096e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 INCENP-203ENST00000528037 1372 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-207ENST00000604975 573 ntTSL 514.13□□□□□ -0.151e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 DCAF8-210ENST00000473382 573 ntTSL 313.82□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 DCAF8-212ENST00000476033 945 ntTSL 213.79□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-218ENST00000560605 576 ntTSL 413.16□□□□□ -0.36e-8■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 PRC1-208ENST00000555791 660 ntTSL 412.95□□□□□ -0.346e-8■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 TPM2-208ENST00000607559 518 ntTSL 210.62□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.881e-6■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-7■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 CCNL2-204ENST00000418865 3082 ntTSL 1 (best)9.64□□□□□ -0.871e-11■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-16■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.494e-10■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-10■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.224e-10■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 CCDC12-208ENST00000603885 560 ntTSL 317.89■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-205ENST00000488069 897 ntTSL 217.89■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-212ENST00000605358 402 ntTSL 517.82■□□□□ 0.441e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-210ENST00000604181 550 ntTSL 416.78■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.071e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-209ENST00000604164 399 ntTSL 311.39□□□□□ -0.591e-7■■□□□ 12.2
TRA2AQ13595 CCDC12-203ENST00000446836 412 ntTSL 310.59□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 12.2
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TRA2AQ13595 RHOT2-207ENST00000562708 672 ntTSL 522.81■■□□□ 1.244e-6■■□□□ 12.1
TRA2AQ13595 RHOT2-216ENST00000567017 1094 ntTSL 522.63■■□□□ 1.214e-6■■□□□ 12.1
TRA2AQ13595 RHOT2-219ENST00000568950 1343 ntTSL 522.05■■□□□ 1.124e-6■■□□□ 12.1
TRA2AQ13595 RHOT2-226ENST00000570280 708 ntTSL 320.66■□□□□ 0.94e-6■■□□□ 12.1
TRA2AQ13595 RHOT2-210ENST00000563637 993 ntTSL 519.52■□□□□ 0.724e-6■■□□□ 12.1
TRA2AQ13595 RHOT2-205ENST00000562333 1052 ntTSL 519.43■□□□□ 0.74e-6■■□□□ 12.1
TRA2AQ13595 RHOT2-211ENST00000563776 923 ntTSL 317.96■□□□□ 0.474e-6■■□□□ 12.1
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