RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570280.5

RHOT2-226, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 3

Gene RHOT2, Length 708 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-226	ENST00000570280	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		52.37	■■■■■ 5.97
RHOT2-226	ENST00000570280	ABCC9	O60706	1549 aa		47.21	■■■■■ 5.15
RHOT2-226	ENST00000570280	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		47.07	■■■■■ 5.13
RHOT2-226	ENST00000570280	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		44.87	■■■■■ 4.77
RHOT2-226	ENST00000570280	NACAD	O15069	1562 aa		44.55	■■■■■ 4.72
RHOT2-226	ENST00000570280	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		44.53	■■■■■ 4.72
RHOT2-226	ENST00000570280	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		44.15	■■■■■ 4.66
RHOT2-226	ENST00000570280	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		43.94	■■■■■ 4.62
RHOT2-226	ENST00000570280	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	43.92	■■■■■ 4.62	7e-7	■■□□□ 14.3
RHOT2-226	ENST00000570280	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		43.87	■■■■■ 4.61
RHOT2-226	ENST00000570280	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		43.63	■■■■■ 4.58
RHOT2-226	ENST00000570280	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	43.38	■■■■■ 4.53
RHOT2-226	ENST00000570280	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		43.29	■■■■■ 4.52
RHOT2-226	ENST00000570280	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		43.03	■■■■■ 4.48
RHOT2-226	ENST00000570280	SCRIB	Q14160	1630 aa		42.82	■■■■■ 4.45
RHOT2-226	ENST00000570280	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		42.67	■■■■■ 4.42
RHOT2-226	ENST00000570280	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		42.57	■■■■■ 4.41
RHOT2-226	ENST00000570280	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
RHOT2-226	ENST00000570280	NCAPD3	P42695	1498 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RHOT2-226	ENST00000570280	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.01	■■■■■ 4.16
RHOT2-226	ENST00000570280	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		40.99	■■■■■ 4.15
RHOT2-226	ENST00000570280	SMARCA4	P51532	1647 aa		40.88	■■■■■ 4.13
RHOT2-226	ENST00000570280	SMARCA2	P51531	1590 aa		40.84	■■■■■ 4.13
RHOT2-226	ENST00000570280	HMGXB3	Q12766	1538 aa		40.82	■■■■■ 4.12
RHOT2-226	ENST00000570280	CUX2	O14529	1486 aa		40.81	■■■■■ 4.12
RHOT2-226	ENST00000570280	ERCC6	Q03468	1493 aa		40.75	■■■■■ 4.11
RHOT2-226	ENST00000570280	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
RHOT2-226	ENST00000570280	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		40.53	■■■■■ 4.08
RHOT2-226	ENST00000570280	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	40.53	■■■■■ 4.08
RHOT2-226	ENST00000570280	NES	P48681	1621 aa		40.53	■■■■■ 4.08
RHOT2-226	ENST00000570280	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		40.35	■■■■■ 4.05
RHOT2-226	ENST00000570280	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		40.23	■■■■■ 4.03
RHOT2-226	ENST00000570280	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
RHOT2-226	ENST00000570280	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		39.99	■■■■□ 3.99
RHOT2-226	ENST00000570280	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		39.98	■■■■□ 3.99
RHOT2-226	ENST00000570280	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		39.87	■■■■□ 3.97
RHOT2-226	ENST00000570280	WIZ	O95785	1651 aa		39.83	■■■■□ 3.97
RHOT2-226	ENST00000570280	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		39.66	■■■■□ 3.94
RHOT2-226	ENST00000570280	WDR62	O43379	1518 aa		39.6	■■■■□ 3.93
RHOT2-226	ENST00000570280	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	39.45	■■■■□ 3.91
RHOT2-226	ENST00000570280	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		39.44	■■■■□ 3.9
RHOT2-226	ENST00000570280	CFTR	P13569	1480 aa		39.4	■■■■□ 3.9
RHOT2-226	ENST00000570280	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		39.4	■■■■□ 3.9
RHOT2-226	ENST00000570280	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	39.33	■■■■□ 3.89
RHOT2-226	ENST00000570280	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	39.11	■■■■□ 3.85
RHOT2-226	ENST00000570280	TRIM41	Q8WV44	630 aa		39.03	■■■■□ 3.84
RHOT2-226	ENST00000570280	PRDM2	Q13029	1718 aa		38.93	■■■■□ 3.82
RHOT2-226	ENST00000570280	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		38.9	■■■■□ 3.82
RHOT2-226	ENST00000570280	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		38.88	■■■■□ 3.81
RHOT2-226	ENST00000570280	IFT140	Q96RY7	1462 aa		38.68	■■■■□ 3.78
RHOT2-226	ENST00000570280	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	38.65	■■■■□ 3.78
RHOT2-226	ENST00000570280	TOPBP1	Q92547	1522 aa		38.64	■■■■□ 3.78
RHOT2-226	ENST00000570280	ABCC8	Q09428	1581 aa		38.54	■■■■□ 3.76
RHOT2-226	ENST00000570280	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		38.48	■■■■□ 3.75
RHOT2-226	ENST00000570280	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	38.41	■■■■□ 3.74
RHOT2-226	ENST00000570280	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		38.41	■■■■□ 3.74
RHOT2-226	ENST00000570280	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		38.41	■■■■□ 3.74
RHOT2-226	ENST00000570280	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		38.41	■■■■□ 3.74
RHOT2-226	ENST00000570280	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	38.34	■■■■□ 3.73
RHOT2-226	ENST00000570280	ARHGEF11	O15085	1522 aa		38.28	■■■■□ 3.72
RHOT2-226	ENST00000570280	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	38.26	■■■■□ 3.72	6e-8	■■■■□ 20.5
RHOT2-226	ENST00000570280	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	38.24	■■■■□ 3.71
RHOT2-226	ENST00000570280	CHD1	O14646	1710 aa		38.14	■■■■□ 3.7
RHOT2-226	ENST00000570280	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		38.09	■■■■□ 3.69
RHOT2-226	ENST00000570280	SOGA1	O94964	1423 aa		38.04	■■■■□ 3.68
RHOT2-226	ENST00000570280	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	37.99	■■■■□ 3.67
RHOT2-226	ENST00000570280	FBLN2	P98095	1184 aa		37.97	■■■■□ 3.67
RHOT2-226	ENST00000570280	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		37.97	■■■■□ 3.67
RHOT2-226	ENST00000570280	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		37.96	■■■■□ 3.67
RHOT2-226	ENST00000570280	WDR97	A6NE52	1622 aa		37.94	■■■■□ 3.66
RHOT2-226	ENST00000570280	CUX1	P39880	1505 aa		37.92	■■■■□ 3.66
RHOT2-226	ENST00000570280	ARAP1	Q96P48	1450 aa		37.9	■■■■□ 3.66
RHOT2-226	ENST00000570280	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		37.86	■■■■□ 3.65
RHOT2-226	ENST00000570280	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	37.77	■■■■□ 3.64
RHOT2-226	ENST00000570280	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		37.76	■■■■□ 3.63
RHOT2-226	ENST00000570280	GRIN2B	Q13224	1484 aa		37.75	■■■■□ 3.63
RHOT2-226	ENST00000570280	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	37.7	■■■■□ 3.63
RHOT2-226	ENST00000570280	SYNJ1	O43426	1573 aa		37.67	■■■■□ 3.62
RHOT2-226	ENST00000570280	SYNJ2	O15056	1496 aa		37.65	■■■■□ 3.62
RHOT2-226	ENST00000570280	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		37.58	■■■■□ 3.61
RHOT2-226	ENST00000570280	PBRM1	Q86U86	1689 aa		37.56	■■■■□ 3.6
RHOT2-226	ENST00000570280	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	37.55	■■■■□ 3.6
RHOT2-226	ENST00000570280	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		37.55	■■■■□ 3.6
RHOT2-226	ENST00000570280	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		37.5	■■■■□ 3.59
RHOT2-226	ENST00000570280	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	37.45	■■■■□ 3.59
RHOT2-226	ENST00000570280	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	37.32	■■■■□ 3.56
RHOT2-226	ENST00000570280	GRIN2A	Q12879	1464 aa		37.26	■■■■□ 3.56
RHOT2-226	ENST00000570280	TOP2B	Q02880	1626 aa		37.25	■■■■□ 3.55
RHOT2-226	ENST00000570280	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		37.25	■■■■□ 3.55
RHOT2-226	ENST00000570280	ADAMTS12	P58397	1594 aa		37.22	■■■■□ 3.55
RHOT2-226	ENST00000570280	NUP160	Q12769	1436 aa		37.18	■■■■□ 3.54
RHOT2-226	ENST00000570280	CEP170	Q5SW79	1584 aa		37.14	■■■■□ 3.54
RHOT2-226	ENST00000570280	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		37.14	■■■■□ 3.54
RHOT2-226	ENST00000570280	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		37.1	■■■■□ 3.53
RHOT2-226	ENST00000570280	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		37.06	■■■■□ 3.52
RHOT2-226	ENST00000570280	SHROOM2	Q13796	1616 aa		37.03	■■■■□ 3.52
RHOT2-226	ENST00000570280	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	36.78	■■■■□ 3.48
RHOT2-226	ENST00000570280	JPH4	Q96JJ6	628 aa		36.76	■■■■□ 3.48
RHOT2-226	ENST00000570280	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		36.7	■■■■□ 3.47
RHOT2-226	ENST00000570280	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		36.59	■■■■□ 3.45

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