RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570092.5

RHOT2-225, Transcript of ras homolog family member T2, humanhuman

TSL 3

Gene RHOT2, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2-225ENST00000570092 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.71■■■■■ 7.31
RHOT2-225ENST00000570092 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.99■■■■■ 6.23
RHOT2-225ENST00000570092 ABCC9O60706 1549 aa53.22■■■■■ 6.11
RHOT2-225ENST00000570092 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.03■■■■■ 5.76
RHOT2-225ENST00000570092 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.02■■■■■ 5.76
RHOT2-225ENST00000570092 NACADO15069 1562 aa50.91■■■■■ 5.74
RHOT2-225ENST00000570092 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.51■■■■■ 5.68
RHOT2-225ENST00000570092 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
RHOT2-225ENST00000570092 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.19■■■■■ 5.62
RHOT2-225ENST00000570092 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.8■■■■■ 5.56
RHOT2-225ENST00000570092 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.78■■■■■ 5.566e-7■■□□□ 13.8
RHOT2-225ENST00000570092 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.48■■■■■ 5.51
RHOT2-225ENST00000570092 SCRIBQ14160 1630 aa49.3■■■■■ 5.48
RHOT2-225ENST00000570092 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.2■■■■■ 5.47
RHOT2-225ENST00000570092 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.91■■■■■ 5.42
RHOT2-225ENST00000570092 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
RHOT2-225ENST00000570092 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.09■■■■■ 5.29
RHOT2-225ENST00000570092 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.85■■■■■ 5.25
RHOT2-225ENST00000570092 SMARCA4P51532 1647 aa47.12■■■■■ 5.13
RHOT2-225ENST00000570092 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.05■■■■■ 5.12
RHOT2-225ENST00000570092 NCAPD3P42695 1498 aa47.02■■■■■ 5.12
RHOT2-225ENST00000570092 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47■■■■■ 5.11
RHOT2-225ENST00000570092 SMARCA2P51531 1590 aa46.9■■■■■ 5.1
RHOT2-225ENST00000570092 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.78■■■■■ 5.08
RHOT2-225ENST00000570092 HMGXB3Q12766 1538 aa46.69■■■■■ 5.06
RHOT2-225ENST00000570092 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.65■■■■■ 5.06
RHOT2-225ENST00000570092 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.58■■■■■ 5.05
RHOT2-225ENST00000570092 WIZO95785 1651 aa46.24■■■■■ 4.99
RHOT2-225ENST00000570092 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.19■■■■■ 4.98
RHOT2-225ENST00000570092 NESP48681 1621 aa45.96■■■■■ 4.95
RHOT2-225ENST00000570092 ERCC6Q03468 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
RHOT2-225ENST00000570092 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.77■■■■■ 4.92
RHOT2-225ENST00000570092 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
RHOT2-225ENST00000570092 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.68■■■■■ 4.9
RHOT2-225ENST00000570092 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.55■■■■■ 4.88
RHOT2-225ENST00000570092 CUX2O14529 1486 aa45.49■■■■■ 4.87
RHOT2-225ENST00000570092 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.34■■■■■ 4.85
RHOT2-225ENST00000570092 CFTRP13569 1480 aa45.29■■■■■ 4.84
RHOT2-225ENST00000570092 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.26■■■■■ 4.84
RHOT2-225ENST00000570092 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
RHOT2-225ENST00000570092 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.1■■■■■ 4.81
RHOT2-225ENST00000570092 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.05■■■■■ 4.8
RHOT2-225ENST00000570092 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.04■■■■■ 4.8
RHOT2-225ENST00000570092 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
RHOT2-225ENST00000570092 WDR62O43379 1518 aa44.87■■■■■ 4.77
RHOT2-225ENST00000570092 PRDM2Q13029 1718 aa44.8■■■■■ 4.76
RHOT2-225ENST00000570092 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
RHOT2-225ENST00000570092 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.54■■■■■ 4.72
RHOT2-225ENST00000570092 ABCC8Q09428 1581 aa44.35■■■■■ 4.69
RHOT2-225ENST00000570092 TOPBP1Q92547 1522 aa44.34■■■■■ 4.69
RHOT2-225ENST00000570092 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.23■■■■■ 4.67
RHOT2-225ENST00000570092 IFT140Q96RY7 1462 aa44.14■■■■■ 4.66
RHOT2-225ENST00000570092 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.97■■■■■ 4.63
RHOT2-225ENST00000570092 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
RHOT2-225ENST00000570092 CUX1P39880 1505 aa43.89■■■■■ 4.62
RHOT2-225ENST00000570092 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
RHOT2-225ENST00000570092 SOGA1O94964 1423 aa43.83■■■■■ 4.61
RHOT2-225ENST00000570092 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.8■■■■■ 4.6
RHOT2-225ENST00000570092 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.79■■■■■ 4.6
RHOT2-225ENST00000570092 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.599e-8■■■■□ 20.5
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RHOT2-225ENST00000570092 OSCARQ8IYS5 282 aa43.69■■■■■ 4.58
RHOT2-225ENST00000570092 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
RHOT2-225ENST00000570092 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.56
RHOT2-225ENST00000570092 WDR97A6NE52 1622 aa43.44■■■■■ 4.55
RHOT2-225ENST00000570092 TOP2BQ02880 1626 aa43.42■■■■■ 4.54
RHOT2-225ENST00000570092 SYNJ1O43426 1573 aa43.39■■■■■ 4.54
RHOT2-225ENST00000570092 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.39■■■■■ 4.54
RHOT2-225ENST00000570092 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.36■■■■■ 4.53
RHOT2-225ENST00000570092 FBLN2P98095 1184 aa43.34■■■■■ 4.53
RHOT2-225ENST00000570092 GRIN2BQ13224 1484 aa43.3■■■■■ 4.52
RHOT2-225ENST00000570092 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.28■■■■■ 4.52
RHOT2-225ENST00000570092 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.25■■■■■ 4.51
RHOT2-225ENST00000570092 CHD1O14646 1710 aa43.2■■■■■ 4.51
RHOT2-225ENST00000570092 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.51
RHOT2-225ENST00000570092 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
RHOT2-225ENST00000570092 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.15■■■■■ 4.5
RHOT2-225ENST00000570092 PBRM1Q86U86 1689 aa43.09■■■■■ 4.49
RHOT2-225ENST00000570092 SYNJ2O15056 1496 aa43.04■■■■■ 4.48
RHOT2-225ENST00000570092 TRIM41Q8WV44 630 aa42.96■■■■■ 4.47
RHOT2-225ENST00000570092 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.86■■■■■ 4.45
RHOT2-225ENST00000570092 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.86■■■■■ 4.45
RHOT2-225ENST00000570092 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.86■■■■■ 4.45
RHOT2-225ENST00000570092 ARHGEF11O15085 1522 aa42.84■■■■■ 4.45
RHOT2-225ENST00000570092 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.82■■■■■ 4.45
RHOT2-225ENST00000570092 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.77■■■■■ 4.44
RHOT2-225ENST00000570092 ADAMTS12P58397 1594 aa42.75■■■■■ 4.43
RHOT2-225ENST00000570092 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.75■■■■■ 4.43
RHOT2-225ENST00000570092 GRIN2AQ12879 1464 aa42.72■■■■■ 4.43
RHOT2-225ENST00000570092 KIF27Q86VH2 1401 aa42.68■■■■■ 4.42
RHOT2-225ENST00000570092 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.61■■■■■ 4.41
RHOT2-225ENST00000570092 IGF1RP08069 1367 aa42.58■■■■■ 4.41
RHOT2-225ENST00000570092 NUP160Q12769 1436 aa42.55■■■■■ 4.4
RHOT2-225ENST00000570092 ARAP1Q96P48 1450 aa42.49■■■■■ 4.39
RHOT2-225ENST00000570092 CEP170Q5SW79 1584 aa42.48■■■■■ 4.39
RHOT2-225ENST00000570092 CUL7Q14999 1698 aa42.34■■■■■ 4.37
RHOT2-225ENST00000570092 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.32■■■■■ 4.37
RHOT2-225ENST00000570092 JPH4Q96JJ6 628 aa42.24■■■■■ 4.35
RHOT2-225ENST00000570092 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.2■■■■■ 4.35
RHOT2-225ENST00000570092 SHROOM2Q13796 1616 aa42.2■■■■■ 4.35
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