RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569706.5

RHOT2-223, Transcript of ras homolog family member T2, human

TSL 3

Gene RHOT2, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOT2-223	ENST00000569706	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.67	■■■■■ 7.14
RHOT2-223	ENST00000569706	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.52	■■■■■ 6.16
RHOT2-223	ENST00000569706	ABCC9	O60706	1549 aa		53.22	■■■■■ 6.11
RHOT2-223	ENST00000569706	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.81	■■■■■ 5.72
RHOT2-223	ENST00000569706	NACAD	O15069	1562 aa		50.55	■■■■■ 5.68
RHOT2-223	ENST00000569706	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		50.04	■■■■■ 5.6
RHOT2-223	ENST00000569706	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.96	■■■■■ 5.59
RHOT2-223	ENST00000569706	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.89	■■■■■ 5.58
RHOT2-223	ENST00000569706	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.68	■■■■■ 5.54
RHOT2-223	ENST00000569706	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.52	■■■■■ 5.52	1e-6	■□□□□ 10.5
RHOT2-223	ENST00000569706	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.51	■■■■■ 5.52
RHOT2-223	ENST00000569706	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.41	■■■■■ 5.5
RHOT2-223	ENST00000569706	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.41	■■■■■ 5.5
RHOT2-223	ENST00000569706	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.83	■■■■■ 5.41
RHOT2-223	ENST00000569706	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.61	■■■■■ 5.37
RHOT2-223	ENST00000569706	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.16	■■■■■ 5.3
RHOT2-223	ENST00000569706	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.12	■■■■■ 5.29
RHOT2-223	ENST00000569706	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.97	■■■■■ 5.27
RHOT2-223	ENST00000569706	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.7	■■■■■ 5.07
RHOT2-223	ENST00000569706	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.53	■■■■■ 5.04
RHOT2-223	ENST00000569706	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.5	■■■■■ 5.03
RHOT2-223	ENST00000569706	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.39	■■■■■ 5.02
RHOT2-223	ENST00000569706	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.35	■■■■■ 5.01
RHOT2-223	ENST00000569706	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.29	■■■■■ 5
RHOT2-223	ENST00000569706	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46.17	■■■■■ 4.98
RHOT2-223	ENST00000569706	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	46	■■■■■ 4.95
RHOT2-223	ENST00000569706	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.94	■■■■■ 4.94
RHOT2-223	ENST00000569706	CUX2	O14529	1486 aa		45.93	■■■■■ 4.94
RHOT2-223	ENST00000569706	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.9	■■■■■ 4.94
RHOT2-223	ENST00000569706	NES	P48681	1621 aa		45.79	■■■■■ 4.92
RHOT2-223	ENST00000569706	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.72	■■■■■ 4.91
RHOT2-223	ENST00000569706	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.58	■■■■■ 4.89
RHOT2-223	ENST00000569706	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.39	■■■■■ 4.86
RHOT2-223	ENST00000569706	WIZ	O95785	1651 aa		45.35	■■■■■ 4.85
RHOT2-223	ENST00000569706	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.26	■■■■■ 4.84
RHOT2-223	ENST00000569706	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.22	■■■■■ 4.83
RHOT2-223	ENST00000569706	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.21	■■■■■ 4.83
RHOT2-223	ENST00000569706	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.06	■■■■■ 4.8
RHOT2-223	ENST00000569706	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.87	■■■■■ 4.77
RHOT2-223	ENST00000569706	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.85	■■■■■ 4.77
RHOT2-223	ENST00000569706	WDR62	O43379	1518 aa		44.81	■■■■■ 4.76
RHOT2-223	ENST00000569706	CFTR	P13569	1480 aa		44.78	■■■■■ 4.76
RHOT2-223	ENST00000569706	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.69	■■■■■ 4.74
RHOT2-223	ENST00000569706	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.66	■■■■■ 4.74
RHOT2-223	ENST00000569706	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.33	■■■■■ 4.69
RHOT2-223	ENST00000569706	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.32	■■■■■ 4.69
RHOT2-223	ENST00000569706	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.31	■■■■■ 4.68
RHOT2-223	ENST00000569706	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.87	■■■■■ 4.61
RHOT2-223	ENST00000569706	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.83	■■■■■ 4.61
RHOT2-223	ENST00000569706	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.8	■■■■■ 4.6
RHOT2-223	ENST00000569706	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.76	■■■■■ 4.6
RHOT2-223	ENST00000569706	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.73	■■■■■ 4.59
RHOT2-223	ENST00000569706	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.72	■■■■■ 4.59
RHOT2-223	ENST00000569706	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.54	■■■■■ 4.56
RHOT2-223	ENST00000569706	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.51	■■■■■ 4.56
RHOT2-223	ENST00000569706	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
RHOT2-223	ENST00000569706	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.43	■■■■■ 4.54
RHOT2-223	ENST00000569706	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.32	■■■■■ 4.52	9e-8	■■■■□ 20.5
RHOT2-223	ENST00000569706	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RHOT2-223	ENST00000569706	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RHOT2-223	ENST00000569706	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.22	■■■■■ 4.51
RHOT2-223	ENST00000569706	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.2	■■■■■ 4.51
RHOT2-223	ENST00000569706	SOGA1	O94964	1423 aa		43.19	■■■■■ 4.5
RHOT2-223	ENST00000569706	CUX1	P39880	1505 aa		43.16	■■■■■ 4.5
RHOT2-223	ENST00000569706	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.14	■■■■■ 4.5
RHOT2-223	ENST00000569706	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.13	■■■■■ 4.49
RHOT2-223	ENST00000569706	CHD1	O14646	1710 aa		43.12	■■■■■ 4.49
RHOT2-223	ENST00000569706	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.11	■■■■■ 4.49
RHOT2-223	ENST00000569706	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.04	■■■■■ 4.48
RHOT2-223	ENST00000569706	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
RHOT2-223	ENST00000569706	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.88	■■■■■ 4.46
RHOT2-223	ENST00000569706	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.85	■■■■■ 4.45
RHOT2-223	ENST00000569706	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RHOT2-223	ENST00000569706	FBLN2	P98095	1184 aa		42.83	■■■■■ 4.45
RHOT2-223	ENST00000569706	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.73	■■■■■ 4.43
RHOT2-223	ENST00000569706	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.73	■■■■■ 4.43
RHOT2-223	ENST00000569706	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.71	■■■■■ 4.43
RHOT2-223	ENST00000569706	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.68	■■■■■ 4.42
RHOT2-223	ENST00000569706	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.68	■■■■■ 4.42
RHOT2-223	ENST00000569706	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RHOT2-223	ENST00000569706	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.66	■■■■■ 4.42
RHOT2-223	ENST00000569706	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.64	■■■■■ 4.42
RHOT2-223	ENST00000569706	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.64	■■■■■ 4.42
RHOT2-223	ENST00000569706	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.63	■■■■■ 4.41
RHOT2-223	ENST00000569706	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.54	■■■■■ 4.4
RHOT2-223	ENST00000569706	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.52	■■■■■ 4.4
RHOT2-223	ENST00000569706	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.51	■■■■■ 4.4
RHOT2-223	ENST00000569706	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.29	■■■■■ 4.36
RHOT2-223	ENST00000569706	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.29	■■■■■ 4.36
RHOT2-223	ENST00000569706	NUP160	Q12769	1436 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RHOT2-223	ENST00000569706	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RHOT2-223	ENST00000569706	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RHOT2-223	ENST00000569706	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.13	■■■■■ 4.33
RHOT2-223	ENST00000569706	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
RHOT2-223	ENST00000569706	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RHOT2-223	ENST00000569706	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42	■■■■■ 4.31
RHOT2-223	ENST00000569706	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.69	■■■■■ 4.27
RHOT2-223	ENST00000569706	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.67	■■■■■ 4.26
RHOT2-223	ENST00000569706	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.67	■■■■■ 4.26
RHOT2-223	ENST00000569706	IGF1R	P08069	1367 aa		41.66	■■■■■ 4.26

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